RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520732.5

UBXN2B-202, Transcript of UBX domain protein 2B, humanhuman

TSL 3

Gene UBXN2B, Length 684 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN2B-202ENST00000520732 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
UBXN2B-202ENST00000520732 KIAA0513O60268 411 aa14.71□□□□□ -0.05
UBXN2B-202ENST00000520732 LY6G6DO95868 133 aa14.71□□□□□ -0.05
UBXN2B-202ENST00000520732 KHKP50053 298 aa14.71□□□□□ -0.05
UBXN2B-202ENST00000520732 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
UBXN2B-202ENST00000520732 CASP9P55211 416 aa14.71□□□□□ -0.05
UBXN2B-202ENST00000520732 KCNJ10P78508 379 aa14.71□□□□□ -0.05
UBXN2B-202ENST00000520732 HPCAP84074 193 aa14.71□□□□□ -0.05
UBXN2B-202ENST00000520732 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
UBXN2B-202ENST00000520732 PDK3Q15120 406 aa14.71□□□□□ -0.05
UBXN2B-202ENST00000520732 MAPK14Q16539 360 aa14.71□□□□□ -0.05
UBXN2B-202ENST00000520732 SYT14P1Q58G82 188 aa14.71□□□□□ -0.05
UBXN2B-202ENST00000520732 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa14.71□□□□□ -0.05
UBXN2B-202ENST00000520732 SPANXN4Q5MJ08 99 aa14.71□□□□□ -0.05
UBXN2B-202ENST00000520732 CEP85LQ5SZL2 805 aa14.71□□□□□ -0.05
UBXN2B-202ENST00000520732 OGFOD2Q6N063 350 aa14.71□□□□□ -0.05
UBXN2B-202ENST00000520732 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
UBXN2B-202ENST00000520732 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
UBXN2B-202ENST00000520732 SPATA19Q7Z5L4 167 aa14.71□□□□□ -0.05
UBXN2B-202ENST00000520732 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
UBXN2B-202ENST00000520732 FAM71CQ8NEG0 241 aa14.71□□□□□ -0.05
UBXN2B-202ENST00000520732 RAB8BQ92930 207 aa14.71□□□□□ -0.05
UBXN2B-202ENST00000520732 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa14.71□□□□□ -0.05
UBXN2B-202ENST00000520732 SLC35A5Q9BS91 424 aa14.71□□□□□ -0.05
UBXN2B-202ENST00000520732 POTEKPQ9BYX7 375 aa14.71□□□□□ -0.05
UBXN2B-202ENST00000520732 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
UBXN2B-202ENST00000520732 EMC3Q9P0I2 261 aa14.71□□□□□ -0.05
UBXN2B-202ENST00000520732 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
UBXN2B-202ENST00000520732 LIPT1Q9Y234 373 aa14.71□□□□□ -0.05
UBXN2B-202ENST00000520732 H6PDO95479 791 aa14.7□□□□□ -0.06
UBXN2B-202ENST00000520732 HTR3AP46098 478 aa14.7□□□□□ -0.06
UBXN2B-202ENST00000520732 ATP5J2P56134 94 aa14.7□□□□□ -0.06
UBXN2B-202ENST00000520732 MPP2Q14168 576 aa14.7□□□□□ -0.06
UBXN2B-202ENST00000520732 TSC22D1Q15714 1073 aa14.7□□□□□ -0.06
UBXN2B-202ENST00000520732 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa14.7□□□□□ -0.06
UBXN2B-202ENST00000520732 GPAT3Q53EU6 434 aa14.7□□□□□ -0.06
UBXN2B-202ENST00000520732 HHATQ5VTY9 493 aa14.7□□□□□ -0.06
UBXN2B-202ENST00000520732 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
UBXN2B-202ENST00000520732 GRINAQ7Z429 371 aa14.7□□□□□ -0.06
UBXN2B-202ENST00000520732 P2RY8Q86VZ1 359 aa14.7□□□□□ -0.06
UBXN2B-202ENST00000520732 ZNF100Q8IYN0 542 aa14.7□□□□□ -0.06
UBXN2B-202ENST00000520732 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
UBXN2B-202ENST00000520732 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa14.7□□□□□ -0.06
UBXN2B-202ENST00000520732 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa14.7□□□□□ -0.06
UBXN2B-202ENST00000520732 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
UBXN2B-202ENST00000520732 PMM1Q92871 262 aa14.7□□□□□ -0.06
UBXN2B-202ENST00000520732 FBXW5Q969U6 566 aa14.7□□□□□ -0.06
UBXN2B-202ENST00000520732 ZG16BQ96DA0 208 aa14.7□□□□□ -0.06
UBXN2B-202ENST00000520732 MUCL1Q96DR8 90 aa14.7□□□□□ -0.06
UBXN2B-202ENST00000520732 CCDC115Q96NT0 180 aa14.7□□□□□ -0.06
UBXN2B-202ENST00000520732 PANX1Q96RD7 426 aa14.7□□□□□ -0.06
UBXN2B-202ENST00000520732 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
UBXN2B-202ENST00000520732 CCDC106Q9BWC9 280 aa14.7□□□□□ -0.06
UBXN2B-202ENST00000520732 PNPOQ9NVS9 261 aa14.7□□□□□ -0.06
UBXN2B-202ENST00000520732 CHRNA9Q9UGM1 479 aa14.7□□□□□ -0.06
UBXN2B-202ENST00000520732 RAB21Q9UL25 225 aa14.7□□□□□ -0.06
UBXN2B-202ENST00000520732 LAMP3Q9UQV4 416 aa14.7□□□□□ -0.06
UBXN2B-202ENST00000520732 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa14.7□□□□□ -0.06
UBXN2B-202ENST00000520732 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa14.69□□□□□ -0.06
UBXN2B-202ENST00000520732 CCDC154A6NI56 674 aa14.69□□□□□ -0.06
UBXN2B-202ENST00000520732 C9JVG2 144 aa14.69□□□□□ -0.06
UBXN2B-202ENST00000520732 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
UBXN2B-202ENST00000520732 CLOCKO15516 846 aa14.69□□□□□ -0.06
UBXN2B-202ENST00000520732 DNPH1O43598 174 aa14.69□□□□□ -0.06
UBXN2B-202ENST00000520732 PMS2P2O95744 297 aa14.69□□□□□ -0.06
UBXN2B-202ENST00000520732 TFPIP10646 304 aa14.69□□□□□ -0.06
UBXN2B-202ENST00000520732 RYKP34925 604 aa14.69□□□□□ -0.06
UBXN2B-202ENST00000520732 MAP2K6P52564 334 aa14.69□□□□□ -0.06
UBXN2B-202ENST00000520732 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
UBXN2B-202ENST00000520732 BST1Q10588 318 aa14.69□□□□□ -0.06
UBXN2B-202ENST00000520732 GNA13Q14344 377 aa14.69□□□□□ -0.06
UBXN2B-202ENST00000520732 FRRS1Q6ZNA5 592 aa14.69□□□□□ -0.06
UBXN2B-202ENST00000520732 OLIG3Q7RTU3 272 aa14.69□□□□□ -0.06
UBXN2B-202ENST00000520732 CMIPQ8IY22 773 aa14.69□□□□□ -0.06
UBXN2B-202ENST00000520732 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
UBXN2B-202ENST00000520732 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
UBXN2B-202ENST00000520732 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
UBXN2B-202ENST00000520732 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
UBXN2B-202ENST00000520732 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
UBXN2B-202ENST00000520732 PRSS50Q9UI38 385 aa14.69□□□□□ -0.06
UBXN2B-202ENST00000520732 PRDM4Q9UKN5 801 aa14.69□□□□□ -0.06
UBXN2B-202ENST00000520732 TRAPPC4Q9Y296 219 aa14.69□□□□□ -0.06
UBXN2B-202ENST00000520732 ROS1P08922 2347 aa14.69□□□□□ -0.06
UBXN2B-202ENST00000520732 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
UBXN2B-202ENST00000520732 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa14.68□□□□□ -0.06
UBXN2B-202ENST00000520732 TRIM64A6NGJ6 449 aa14.68□□□□□ -0.06
UBXN2B-202ENST00000520732 TRIM64BA6NI03 449 aa14.68□□□□□ -0.06
UBXN2B-202ENST00000520732 TRPC5OSA6NMA1 111 aa14.68□□□□□ -0.06
UBXN2B-202ENST00000520732 HMGN4O00479 90 aa14.68□□□□□ -0.06
UBXN2B-202ENST00000520732 GPR171O14626 319 aa14.68□□□□□ -0.06
UBXN2B-202ENST00000520732 PGRP06401 933 aa14.68□□□□□ -0.06
UBXN2B-202ENST00000520732 GGT1P19440 569 aa14.68□□□□□ -0.06
UBXN2B-202ENST00000520732 UFM1P61960 85 aa14.68□□□□□ -0.06
UBXN2B-202ENST00000520732 CHRNEQ04844 493 aa14.68□□□□□ -0.06
UBXN2B-202ENST00000520732 PPA1Q15181 289 aa14.68□□□□□ -0.06
UBXN2B-202ENST00000520732 ETFDHQ16134 617 aa14.68□□□□□ -0.06
UBXN2B-202ENST00000520732 TIMM23BQ5SRD1 257 aa14.68□□□□□ -0.06
UBXN2B-202ENST00000520732 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa14.68□□□□□ -0.06
UBXN2B-202ENST00000520732 ZNF621Q6ZSS3 439 aa14.68□□□□□ -0.06
UBXN2B-202ENST00000520732 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms