RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 RETREG3Q86VR2 466 aa16.69■□□□□ 0.26
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SH3BP2-218ENST00000511185 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
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SH3BP2-218ENST00000511185 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa16.65■□□□□ 0.26
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