RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 DNAJC13O75165 2243 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC22A20A6NK97 555 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 CLDN24A6NM45 220 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 CLCA1A8K7I4 914 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 C17orf51A8MQB3 221 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 AP3D1O14617 1153 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 OIP5O43482 229 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 ZG16O60844 167 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 RCBTB2O95199 551 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 CLDN14O95500 239 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 LGI1O95970 557 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 PNMTP11086 282 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 CTSSP25774 331 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 AQP1P29972 269 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 KDELR2P33947 212 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 KCNJ5P48544 419 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC7A2P52569 658 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 CLDN15P56746 228 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 NUP107P57740 925 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 RAC3P60763 192 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 LIPEQ05469 1076 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 C3P1Q6ZMU1 363 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 MCEMP1Q8IX19 187 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC43A2Q8N370 569 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 CLIP4Q8N3C7 705 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 FITM2Q8N6M3 262 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 OR5M1Q8NGP8 315 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 SDCCAG3Q96C92 435 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 SFXN3Q9BWM7 321 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 ADAM19Q9H013 955 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC24A3Q9HC58 644 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 GP6Q9HCN6 339 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 FANCFQ9NPI8 374 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 RLIMQ9NVW2 624 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 ADA2Q9NZK5 511 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 ABCD2Q9UBJ2 740 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 TFPIP10646 304 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 SYT14P1Q58G82 188 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 DCST1Q5T197 706 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 RTL6Q6ICC9 239 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 ULK3Q6PHR2 472 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 HMGN2P46Q86SG4 172 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 C10orf111Q8N326 155 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 CADM2Q8N3J6 435 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 OR52E4Q8NGH9 312 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 OR10D3Q8NH80 312 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 LILRB4Q8NHJ6 448 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 OSTF1Q92882 214 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC47A1Q96FL8 570 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 POTEKPQ9BYX7 375 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 PIGMQ9H3S5 423 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 PIF1Q9H611 641 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 KCNJ16Q9NPI9 418 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 CMTM6Q9NX76 183 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 TMEM181Q9P2C4 612 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 RPS6KA6Q9UK32 745 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 TRAPPC4Q9Y296 219 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNHIT1O43257 154 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 PLGP00747 810 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 HTR1EP28566 365 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 TACR3P29371 465 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 SFTPDP35247 375 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 RASSF2P50749 326 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 CLDN20P56880 219 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 ADORA2A-AS1P86434 159 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 TMPPEQ6ZT21 453 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 GGNQ86UU5 652 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 STK35Q8TDR2 534 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 TRIM8Q9BZR9 551 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 C1orf21Q9H246 121 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 CTPS2Q9NRF8 586 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 ARL8BQ9NVJ2 186 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 CLCF1Q9UBD9 225 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 OSGIN1Q9UJX0 560 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 RNF6Q9Y252 685 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 TMED7Q9Y3B3 224 aa13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.9 ms