RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498530.5

PMPCB-208, Transcript of peptidase, mitochondrial processing beta subunit, human

TSL 2

Gene PMPCB, Length 1,161 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PMPCB-208	ENST00000498530	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	CSRP3	P50461	194 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	VLDLR	P98155	873 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	IL18R1	Q13478	541 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	CRMP1	Q14194	572 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	MEDAG	Q5VYS4	303 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	FAM199X	Q6PEV8	388 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	UQCC3	Q6UW78	93 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	ENPP6	Q6UWR7	440 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	OFCC1	Q8IZS5	231 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	SLC38A4	Q969I6	547 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	NUS1	Q96E22	293 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	C12orf42	Q96LP6	360 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	NIPAL2	Q9H841	368 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	ZNF160	Q9HCG1	818 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	NUDT4	Q9NZJ9	180 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	PTPRG	P23470	1445 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	ARPC4-TTLL3	A0A0A6YYG9	625 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	CCDC182	A6NF36	153 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	TRABD2B	A6NFA1	517 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	CT45A10	P0DMU9	189 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	RALB	P11234	206 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	SERPINA2	P20848	420 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	FDFT1	P37268	417 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	ALDH3B2	P48448	385 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	GSK3B	P49841	420 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	CDH6	P55285	790 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	KRTAP10-9	P60411	292 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	CDK16	Q00536	496 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	ST3GAL3	Q11203	375 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	MICB	Q29980	383 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	UTS2B	Q765I0	119 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	LRRC49	Q8IUZ0	686 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	OR2L13	Q8N349	312 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	OR2T33	Q8NG76	320 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	HAVCR1	Q96D42	359 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	TIMD4	Q96H15	378 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	CCDC28B	Q9BUN5	200 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	OPN3	Q9H1Y3	402 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	ZNF385D	Q9H6B1	395 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	ZNF696	Q9H7X3	374 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	NMRAL1	Q9HBL8	299 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	SENP1	Q9P0U3	644 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	PSMC3IP	Q9P2W1	217 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	SLC7A8	Q9UHI5	535 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	RNF24	Q9Y225	148 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530		A0A1B0GTQ1	180 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530		B4DXG7	233 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	SPECC1L-ADORA2A	F8WAN1	911 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	DNAJB6	O75190	326 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	POLR2M	P0CAP2	368 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	UGT1A4	P22310	534 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	GNA11	P29992	359 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	ACVR1B	P36896	505 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	OPRD1	P41143	372 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	RAB9A	P51151	201 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	ATP4B	P51164	291 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	EFNA3	P52797	238 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	PUDP	Q08623	228 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	ZNF77	Q15935	545 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	SCD5	Q86SK9	330 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	OR7G2	Q8NG99	324 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	ADAMTS16	Q8TE57	1224 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	NPRL2	Q8WTW4	380 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	GIMAP1	Q8WWP7	306 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	FAF2	Q96CS3	445 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	CELF6	Q96J87	481 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	PANX1	Q96RD7	426 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	DPH7	Q9BTV6	452 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	TM2D1	Q9BX74	207 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	NHEJ1	Q9H9Q4	299 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	L3MBTL1	Q9Y468	752 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63

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