RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491867.5

ATG4B-222, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4B, Length 435 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-222ENST00000491867 NKX2-2O95096 273 aa12.06□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 MYL2P10916 166 aa12.06□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 PRPS2P11908 318 aa12.06□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 EPHA1P21709 976 aa12.06□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 NAA20P61599 178 aa12.06□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 SLC25A3Q00325 362 aa12.06□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 VPS26BQ4G0F5 336 aa12.06□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 OR7E24Q6IFN5 339 aa12.06□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 APH1AQ96BI3 265 aa12.06□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 EGLN2Q96KS0 407 aa12.06□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 MRGPRX4Q96LA9 322 aa12.06□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 SAP130Q9H0E3 1048 aa12.06□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 RAB1BQ9H0U4 201 aa12.06□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa12.06□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 UBQLN4Q9NRR5 601 aa12.06□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 HIF1ANQ9NWT6 349 aa12.06□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 ARMCX1Q9P291 453 aa12.06□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 DCDC2Q9UHG0 476 aa12.06□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 USP22Q9UPT9 525 aa12.06□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 CCL27Q9Y4X3 112 aa12.06□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 SCDO00767 359 aa12.05□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 OIP5O43482 229 aa12.05□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 SEC22BO75396 215 aa12.05□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 ITGA5P08648 1049 aa12.05□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 IFNGR1P15260 489 aa12.05□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 PRPH2P23942 346 aa12.05□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 GPC1P35052 558 aa12.05□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 ZNF117Q03924 483 aa12.05□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 KIAA0040Q15053 153 aa12.05□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 C9orf135Q5VTT2 229 aa12.05□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa12.05□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 CNPY4Q8N129 248 aa12.05□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 CDRT4Q8N9R6 151 aa12.05□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 FBXO30Q8TB52 745 aa12.05□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 TMEM186Q96B77 213 aa12.05□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 MS4A4EQ96PG1 132 aa12.05□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 LPAR2Q9HBW0 351 aa12.05□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 EMC3Q9P0I2 261 aa12.05□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 TBK1Q9UHD2 729 aa12.05□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa12.05□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa12.04□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 B9A039 149 aa12.04□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 NPIPB8E9PQR5 432 aa12.04□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 GLRA3O75311 464 aa12.04□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 KCNK2O95069 426 aa12.04□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 PROCP04070 461 aa12.04□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 UROSP10746 265 aa12.04□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 ACP2P11117 423 aa12.04□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 NTF4P34130 210 aa12.04□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 PPOXP50336 477 aa12.04□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 DNAJB13P59910 316 aa12.04□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 SELENBP1Q13228 472 aa12.04□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 RIN1Q13671 783 aa12.04□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 ADIPOQQ15848 244 aa12.04□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 CFAP157Q5JU67 520 aa12.04□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 CLEC6AQ6EIG7 209 aa12.04□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 CBLN3Q6UW01 205 aa12.04□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 ZNF786Q8N393 782 aa12.04□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 CEP70Q8NHQ1 597 aa12.04□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 ZFP28Q8NHY6 868 aa12.04□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 ZNF524Q96C55 264 aa12.04□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 GIMAP5Q96F15 307 aa12.04□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 OR5B2Q96R09 309 aa12.04□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 CCT7Q99832 543 aa12.04□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 PLK3Q9H4B4 646 aa12.04□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 SLC17A5Q9NRA2 495 aa12.04□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 CA10Q9NS85 328 aa12.04□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 C1orf109Q9NX04 203 aa12.04□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 MALT1Q9UDY8 824 aa12.04□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 AMDHD2Q9Y303 409 aa12.04□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa12.04□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa12.04□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa12.03□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 A0A1W2PPM1 405 aa12.03□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 A0A1W2PQD3 144 aa12.03□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 TBX19O60806 448 aa12.03□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 H6PDO95479 791 aa12.03□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 OR4A8P0C604 315 aa12.03□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 ARAFP10398 606 aa12.03□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 PRKCAP17252 672 aa12.03□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 SDC1P18827 310 aa12.03□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 FRKP42685 505 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 PRKAG1P54619 331 aa12.03□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 FOXL1Q12952 345 aa12.03□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 PDE7AQ13946 482 aa12.03□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 DUSP5Q16690 384 aa12.03□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 ZNF385BQ569K4 471 aa12.03□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 VHLLQ6RSH7 139 aa12.03□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 SZRD1Q7Z422 152 aa12.03□□□□□ -0.48
ATG4B-222ENST00000491867 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms