RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490813.5

CEP170-216, Transcript of centrosomal protein 170, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene CEP170, Length 1,070 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CEP170-216	ENST00000490813	ARL1	P40616	181 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	PGGT1B	P53609	377 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	SLC18A2	Q05940	514 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	SELENBP1	Q13228	472 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	GTF2H2	Q13888	395 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	SLC29A2	Q14542	456 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	ZNF460	Q14592	562 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	OR4D1	Q15615	310 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	LTB4R	Q15722	352 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	GRAMD1B	Q3KR37	738 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	TMEM176B	Q3YBM2	270 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	FBXO48	Q5FWF7	155 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	STEAP4	Q687X5	459 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	ACSM5	Q6NUN0	579 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	GTF2H2C	Q6P1K8	395 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	C3orf33	Q6P1S2	294 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	CCDC137	Q6PK04	289 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	COMMD6	Q7Z4G1	85 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	REC114	Q7Z4M0	266 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	SPATA19	Q7Z5L4	167 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	RNF175	Q8N4F7	328 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	BHLHE22	Q8NFJ8	381 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	IL17RD	Q8NFM7	739 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	OR4N2	Q8NGD1	307 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	OR6Y1	Q8NGX8	325 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	UBE2F	Q969M7	185 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	TM4SF18	Q96CE8	201 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	RAB39B	Q96DA2	213 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	BOD1	Q96IK1	185 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	MRGPRX4	Q96LA9	322 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	UBXN10	Q96LJ8	280 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	CCT8L2	Q96SF2	557 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	ZNF416	Q9BWM5	594 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	MRPL1	Q9BYD6	325 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	ELOVL6	Q9H5J4	265 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	TMEM185B	Q9H7F4	350 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	PPCS	Q9HAB8	311 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	DYNLRB1	Q9NP97	96 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	SLC17A5	Q9NRA2	495 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	UBQLN4	Q9NRR5	601 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	SERINC1	Q9NRX5	453 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	UPB1	Q9UBR1	384 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	ZNF69	Q9UC07	566 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	KLHL21	Q9UJP4	597 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	C19orf53	Q9UNZ5	99 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	CAPN6	Q9Y6Q1	641 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	GOLGA6L10	A0A0M3HER8	536 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	ATP6V1G2-DDX39B	F2Z307	99 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	CLDN34	H7C241	214 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	DNALI1	O14645	258 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	PIP5K1B	O14986	540 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	WISP3	O95389	354 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	NTN1	O95631	604 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	OXSR1	O95747	527 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	NUDT14	O95848	222 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	SCGB1D2	O95969	90 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	OPN1LW	P04000	364 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	OR4A8	P0C604	315 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	LINGO3	P0C6S8	592 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	GAA	P10253	952 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	HSD3B1	P14060	373 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	GFAP	P14136	432 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	NPR2	P20594	1047 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	ACHE	P22303	614 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	CRABP2	P29373	138 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	SPR	P35270	261 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	ELK3	P41970	407 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	RFX3	P48380	749 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	FNTA	P49354	379 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	EVX1	P49640	407 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	P2RX1	P51575	399 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	CCNG1	P51959	295 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	RPS26	P62854	115 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	SPOCK1	Q08629	439 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	CCNI	Q14094	377 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	PPP1R7	Q15435	360 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	FAM83E	Q2M2I3	478 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	DOK3	Q7L591	496 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	ISCA2	Q86U28	154 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	ZNF527	Q8NB42	609 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	NUP37	Q8NFH4	326 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	OR9A2	Q8NGT5	310 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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