RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	GPR119	Q8TDV5	335 aa		15.48	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	CPNE4	Q96A23	557 aa	Predicted RBP	15.48	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	KLHL15	Q96M94	604 aa		15.48	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	RNF145	Q96MT1	663 aa		15.48	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		15.48	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		15.48	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	PRRG4	Q9BZD6	226 aa		15.48	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	LAT2	Q9GZY6	243 aa		15.48	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		15.48	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	EFCAB1	Q9HAE3	211 aa		15.48	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	SLAMF8	Q9P0V8	285 aa		15.48	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	ARMCX1	Q9P291	453 aa		15.48	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	PROCR	Q9UNN8	238 aa		15.48	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC35A3	Q9Y2D2	325 aa		15.48	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	AP3M1	Q9Y2T2	418 aa		15.48	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	NPIPA5	A0A0B4J1W7	369 aa		15.47	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	SERINC4	A6NH21	518 aa		15.47	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	NPIPA7	E9PJI5	369 aa		15.47	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF264	O43296	627 aa		15.47	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM107A	O95990	144 aa		15.47	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	CSTA	P01040	98 aa		15.47	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	BCHE	P06276	602 aa		15.47	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	DBI	P07108	87 aa	Known RBP	15.47	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	TFPT	P0C1Z6	253 aa		15.47	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	NPIPA8	P0DM63	369 aa		15.47	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	UBL4A	P11441	157 aa		15.47	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	IL7R	P16871	459 aa		15.47	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	GPX2	P18283	190 aa		15.47	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	TCEA1	P23193	301 aa	Known RBP	15.47	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC6A2	P23975	617 aa		15.47	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	UGT2B10	P36537	528 aa		15.47	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	CARD18	P57730	90 aa		15.47	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	CHRNE	Q04844	493 aa		15.47	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	CBFB	Q13951	182 aa		15.47	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	15.47	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	15.47	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	PRAMEF8	Q5VWM4	474 aa		15.47	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	PRAMEF7	Q5VXH5	474 aa		15.47	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	PAMR1	Q6UXH9	720 aa		15.47	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	BEND4	Q6ZU67	534 aa		15.47	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	KRT73	Q86Y46	540 aa		15.47	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	CMIP	Q8IY22	773 aa		15.47	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	LILRA2	Q8N149	483 aa		15.47	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC43A2	Q8N370	569 aa		15.47	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		15.47	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	ANKFN1	Q8N957	763 aa		15.47	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	OR5M1	Q8NGP8	315 aa		15.47	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	ST8SIA1	Q92185	356 aa		15.47	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	NRGN	Q92686	78 aa		15.47	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	OSTF1	Q92882	214 aa		15.47	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	USB1	Q9BQ65	265 aa	Known RBP	15.47	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	A4GALT	Q9NPC4	353 aa		15.47	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC25A37	Q9NYZ2	338 aa		15.47	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A0J9YW62	118 aa		15.46	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	UGT2B17	O75795	530 aa		15.46	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	CYP7B1	O75881	506 aa		15.46	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	SMNDC1	O75940	238 aa	Known RBP eCLIP	15.46	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	AQP8	O94778	261 aa		15.46	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	RAF1	P04049	648 aa		15.46	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	BMP2	P12643	396 aa		15.46	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	COX4I1	P13073	169 aa		15.46	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	POU2F1	P14859	743 aa		15.46	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	HOXB9	P17482	250 aa	Predicted RBP	15.46	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	MVD	P53602	400 aa		15.46	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	CTBP2	P56545	445 aa		15.46	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	CYP51A1	Q16850	503 aa		15.46	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	FBXW10	Q5XX13	1052 aa		15.46	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	HBM	Q6B0K9	141 aa		15.46	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	REP15	Q6BDI9	236 aa		15.46	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	REEP3	Q6NUK4	255 aa		15.46	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	FRRS1	Q6ZNA5	592 aa		15.46	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	STK32C	Q86UX6	486 aa		15.46	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	RETREG3	Q86VR2	466 aa		15.46	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC30A8	Q8IWU4	369 aa		15.46	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	BBS10	Q8TAM1	723 aa		15.46	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC38A5	Q8WUX1	472 aa		15.46	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	LRRC58	Q96CX6	371 aa		15.46	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	15.46	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	REXO5	Q96IC2	774 aa	Known RBP	15.46	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	ECSIT	Q9BQ95	431 aa		15.46	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		15.46	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		15.46	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		15.46	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	CARD8	Q9Y2G2	431 aa		15.46	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	IFT52	Q9Y366	437 aa		15.46	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	TRBV5-3	A0A0A0MS03	114 aa		15.45	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	FBP2	O00757	339 aa		15.45	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	GMFG	O60234	142 aa		15.45	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	15.45	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	CHRM4	P08173	479 aa		15.45	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	UQCRB	P14927	111 aa		15.45	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	PRKCA	P17252	672 aa		15.45	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	CRYGS	P22914	178 aa		15.45	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	PRDX6	P30041	224 aa		15.45	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	RIPPLY3	P57055	190 aa		15.45	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	RAC3	P60763	192 aa		15.45	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	CDK6	Q00534	326 aa		15.45	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM27E3	Q08E93	113 aa		15.45	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	RBBP4	Q09028	425 aa		15.45	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	SELENBP1	Q13228	472 aa		15.45	■□□□□ 0.06

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms