RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488990.5

TRDMT1-210, Transcript of tRNA aspartic acid methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRDMT1, Length 1,301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1-210ENST00000488990 CCL27Q9Y4X3 112 aa6.69□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa6.69□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 TMEM233B4DJY2 109 aa6.68□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 E7ENX8 843 aa6.68□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 SLC28A1O00337 649 aa6.68□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 TIMM23O14925 209 aa6.68□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 PIP5K1BO14986 540 aa6.68□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 LSM1O15116 133 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 P2RX6O15547 441 aa6.68□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 OR4F21O95013 312 aa6.68□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 KRT6AP02538 564 aa6.68□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 KRT6BP04259 564 aa6.68□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 T-ENOLP0DO92 83 aa6.68□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 CYP4B1P13584 511 aa6.68□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 IDO1P14902 403 aa6.68□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 LBPP18428 481 aa6.68□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 GNAZP19086 355 aa6.68□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 HRH2P25021 359 aa6.68□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 GDF1P27539 372 aa6.68□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 PIK3CBP42338 1070 aa6.68□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 KRT6CP48668 564 aa6.68□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 CLCN2P51788 898 aa6.68□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 FOXA1P55317 472 aa6.68□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 NCALDP61601 193 aa6.68□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 TBPL1P62380 186 aa6.68□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa6.68□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa6.68□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 CLEC6AQ6EIG7 209 aa6.68□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 LAS2Q8IYD9 372 aa6.68□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 KRT78Q8N1N4 520 aa6.68□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 ZPLD1Q8TCW7 415 aa6.68□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 APIPQ96GX9 242 aa6.68□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 PPP3R2Q96LZ3 170 aa6.68□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 FOXN4Q96NZ1 517 aa6.68□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 RASL10BQ96S79 203 aa6.68□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 PKP4Q99569 1192 aa6.68□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 CITED1Q99966 193 aa6.68□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 EFCAB11Q9BUY7 163 aa6.68□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 PELI2Q9HAT8 420 aa6.68□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 NDE1Q9NXR1 346 aa6.68□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 CORO2BQ9UQ03 480 aa6.68□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 KLK4Q9Y5K2 254 aa6.68□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 SNX13Q9Y5W8 968 aa6.68□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 KCNE2Q9Y6J6 123 aa6.68□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 CAPN7Q9Y6W3 813 aa6.68□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa6.67□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 E9PBE3 544 aa6.67□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 H0YIG0 161 aa6.67□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 SGK494L7N484 410 aa6.67□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 WWP2O00308 870 aa6.67□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 PPP6CO00743 305 aa6.67□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 CLGNO14967 610 aa6.67□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 UBDO15205 165 aa6.67□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 RGS14O43566 566 aa6.67□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 CRCPO75575 148 aa6.67□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 NPPBP16860 134 aa6.67□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 TNFRSF1AP19438 455 aa6.67□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 PCMT1P22061 227 aa6.67□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 HMOX2P30519 316 aa6.67□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 SLC7A1P30825 629 aa6.67□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 BDKRB1P46663 353 aa6.67□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 PRIM2P49643 509 aa6.67□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 PDLIM4P50479 330 aa6.67□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 ARFIP1P53367 373 aa6.67□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 C21orf58P58505 322 aa6.67□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 STX1BP61266 288 aa6.67□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 RELAQ04206 551 aa6.67□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 EMX2Q04743 252 aa6.67□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 FAM53BQ14153 422 aa6.67□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 NAA25Q14CX7 972 aa6.67□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 CARTPTQ16568 116 aa6.67□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 DNAL1Q4LDG9 190 aa6.67□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa6.67□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 PAGE2BQ5JRK9 111 aa6.67□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa6.67□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 PRAMEF20Q5VT98 475 aa6.67□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa6.67□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 C11orf71Q6IPW1 123 aa6.67□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 LEG1Q6P5S2 330 aa6.67□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 SUSD1Q6UWL2 747 aa6.67□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 HACD2Q6Y1H2 254 aa6.67□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa6.67□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 C17orf107Q6ZR85 190 aa6.67□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 Q6ZSR9 355 aa6.67□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 VPS37AQ8NEZ2 397 aa6.67□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 ABHD11Q8NFV4 315 aa6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms