RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488923.1

HDLBP-243, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-243ENST00000488923 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 TMEM43Q9BTV4 400 aa6.1□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 ASPNQ9BXN1 380 aa6.1□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa6.1□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 OR51E2Q9H255 320 aa6.1□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 ZNF304Q9HCX3 659 aa6.1□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 LANCL2Q9NS86 450 aa6.1□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 C2orf42Q9NWW7 574 aa6.1□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 ASB6Q9NWX5 421 aa6.1□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 ETAA1Q9NY74 926 aa6.1□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 HAO2Q9NYQ3 351 aa6.1□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 KCNE5Q9UJ90 142 aa6.1□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 ICAM5Q9UMF0 924 aa6.1□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 SLC6A14Q9UN76 642 aa6.1□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 SIGLEC7Q9Y286 467 aa6.1□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 SLC6A5Q9Y345 797 aa6.1□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 A0A087WUJ7 227 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 A0A1W2PQD3 144 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 C17orf105B2RV13 164 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 BHLHE40O14503 412 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 TO15178 435 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 HCRTR1O43613 425 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 PTP4A3O75365 173 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 GKN3PP0CG01 181 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 UBL4AP11441 157 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 CKMT1AP12532 417 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 PRG2P13727 222 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 APEHP13798 732 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 IL9P15248 144 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 MAOAP21397 527 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 TBXA2RP21731 343 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 NOS3P29474 1203 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 HOXD12P35452 270 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 IDUAP35475 653 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 ETV5P41161 510 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 RFX3P48380 749 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 ETV1P50549 477 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 GAS1P54826 345 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 MLLT10P55197 1068 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 GFERP55789 205 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 SLC37A1P57057 533 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 BTG2P78543 158 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 HOXC5Q00444 222 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 HSF2Q03933 536 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 ZP2Q05996 745 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 IL10RAQ13651 578 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 NR0B2Q15466 257 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 SSX1Q16384 188 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 KLHL26Q53HC5 615 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 ARHGAP40Q5TG30 622 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 NIPAL3Q6P499 406 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 TMEM71Q6P5X7 295 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 SHISA2Q6UWI4 295 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 C5orf46Q6UWT4 87 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 DCDC5Q6ZRR9 648 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 TTLL10Q6ZVT0 673 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 SLC29A4Q7RTT9 530 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 WDR5BQ86VZ2 330 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 TMEM151BQ8IW70 566 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 SLC35F3Q8IY50 421 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 MFSD4AQ8N468 514 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 POMGNT2Q8NAT1 580 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 SIMC1Q8NDZ2 872 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 FAM71CQ8NEG0 241 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 LIPHQ8WWY8 451 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 NAT6Q93015 286 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 HSPBAP1Q96EW2 488 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 CENPOQ9BU64 300 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 CCDC32Q9BV29 185 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 IFT27Q9BW83 186 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 YIPF2Q9BWQ6 316 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 CDADC1Q9BWV3 514 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 MROQ9BYG7 248 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 RBCK1Q9BYM8 510 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 DPH1Q9BZG8 443 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 TGIF2Q9GZN2 237 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 KCNN2Q9H2S1 579 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 SP140LQ9H930 580 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 CPNE5Q9HCH3 593 aa6.09□□□□□ -1.43
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