RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486941.1

SNRNP40-205, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U5 subunit 40, human

TSL 2

Gene SNRNP40, Length 743 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNRNP40-205	ENST00000486941	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	COPS7B	Q9H9Q2	264 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	POPDC3	Q9HBV1	291 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	PROK2	Q9HC23	129 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	PPAN	Q9NQ55	473 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	DNAJC11	Q9NVH1	559 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	SDAD1	Q9NVU7	687 aa	Known RBP eCLIP	3.58	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	MS4A12	Q9NXJ0	267 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	CNIH4	Q9P003	139 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	SPRR3	Q9UBC9	169 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	CTNNAL1	Q9UBT7	734 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	COPS7A	Q9UBW8	275 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	NFU1	Q9UMS0	254 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	BOK	Q9UMX3	212 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	IKBKG	Q9Y6K9	419 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	SPACA6	W5XKT8	324 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	ATR	Q13535	2644 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	GOLGA6L10	A0A0M3HER8	536 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	IQANK1	A0A1B0GTG1	560 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	TUBAL3	A6NHL2	446 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	PGRMC1	O00264	195 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	TP53I11	O14683	189 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	TAPBP	O15533	448 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	ITM2A	O43736	263 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	FGF17	O60258	216 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	TRIM3	O75382	744 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	BANF1	O75531	89 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	STK16	O75716	305 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	SNX4	O95219	450 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	WISP3	O95389	354 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	HIST1H1T	P22492	207 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	CPN2	P22792	545 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	SERPINB1	P30740	379 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	TLX1	P31314	330 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	OPRM1	P35372	400 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	RPL21	P46778	160 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	ARFIP1	P53367	373 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	TAS2R39	P59534	338 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	SORD	Q00796	357 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	IRF8	Q02556	426 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	CHIT1	Q13231	466 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	SNTA1	Q13424	505 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	DOC2A	Q14183	400 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	MORF4L2	Q15014	288 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	TSN	Q15631	228 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	NTRK2	Q16620	822 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	AP5B1	Q2VPB7	878 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	C18orf21	Q32NC0	220 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	GALNTL6	Q49A17	601 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	ACSF3	Q4G176	576 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	NHSL2	Q5HYW2	709 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	PAGE2B	Q5JRK9	111 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	PRAMEF20	Q5VT98	475 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	SHE	Q5VZ18	495 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	NSUN5P2	Q63ZY6	315 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	TMEM198	Q66K66	360 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	SULT1C3	Q6IMI6	304 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	ADNP2	Q6IQ32	1131 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	FRA10AC1	Q70Z53	315 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	C9orf40	Q8IXQ3	194 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	PM20D2	Q8IYS1	436 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	ST13P4	Q8IZP2	240 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	LIX1	Q8N485	282 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	POC1A	Q8NBT0	407 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	NAXE	Q8NCW5	288 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	WFDC11	Q8NEX6	87 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	TNIP2	Q8NFZ5	429 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	ACTRT1	Q8TDG2	376 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	ANKRD49	Q8WVL7	239 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	TANK	Q92844	425 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	ARSG	Q96EG1	525 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	CFAP36	Q96G28	342 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	CAPZA3	Q96KX2	299 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	RUNDC3B	Q96NL0	473 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	DACH2	Q96NX9	599 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	DGAT2	Q96PD7	388 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	SECISBP2	Q96T21	854 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	KRT12	Q99456	494 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	MAPKAP1	Q9BPZ7	522 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	PELO	Q9BRX2	385 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	DOHH	Q9BU89	302 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	MS4A8	Q9BY19	250 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	DERL2	Q9GZP9	239 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	RHOJ	Q9H4E5	214 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	PCNX3	Q9H6A9	2034 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	RPF2	Q9H7B2	306 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	CALHM2	Q9HA72	323 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	BEX4	Q9NWD9	120 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	MALT1	Q9UDY8	824 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	FETUB	Q9UGM5	382 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	ASIC3	Q9UHC3	531 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	PTBP2	Q9UKA9	531 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SNRNP40-205	ENST00000486941	PSAT1	Q9Y617	370 aa		3.57	□□□□□ -1.84

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