RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486260.5

THBS3-207, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 5

Gene THBS3, Length 1,763 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-207ENST00000486260 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
THBS3-207ENST00000486260 OSGIN1Q9UJX0 560 aa14.98□□□□□ -0.01
THBS3-207ENST00000486260 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
THBS3-207ENST00000486260 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
THBS3-207ENST00000486260 USP24Q9UPU5 2620 aa14.97□□□□□ -0.01
THBS3-207ENST00000486260 TNFRSF11BO00300 401 aa14.97□□□□□ -0.01
THBS3-207ENST00000486260 CHP2O43745 196 aa14.97□□□□□ -0.01
THBS3-207ENST00000486260 CELA3AP09093 270 aa14.97□□□□□ -0.01
THBS3-207ENST00000486260 PTNP21246 168 aa14.97□□□□□ -0.01
THBS3-207ENST00000486260 MERTKQ12866 999 aa14.97□□□□□ -0.01
THBS3-207ENST00000486260 SLC25A53Q5H9E4 307 aa14.97□□□□□ -0.01
THBS3-207ENST00000486260 COLEC12Q5KU26 742 aa14.97□□□□□ -0.01
THBS3-207ENST00000486260 WDR88Q6ZMY6 472 aa14.97□□□□□ -0.01
THBS3-207ENST00000486260 SLC22A16Q86VW1 577 aa14.97□□□□□ -0.01
THBS3-207ENST00000486260 SLC38A4Q969I6 547 aa14.97□□□□□ -0.01
THBS3-207ENST00000486260 ZBTB8AQ96BR9 441 aa14.97□□□□□ -0.01
THBS3-207ENST00000486260 PRSS27Q9BQR3 290 aa14.97□□□□□ -0.01
THBS3-207ENST00000486260 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa14.97□□□□□ -0.01
THBS3-207ENST00000486260 A0A1W2PRQ8 180 aa14.96□□□□□ -0.01
THBS3-207ENST00000486260 ACOT7O00154 380 aa14.96□□□□□ -0.01
THBS3-207ENST00000486260 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
THBS3-207ENST00000486260 THRBP10828 461 aa14.96□□□□□ -0.01
THBS3-207ENST00000486260 CCNA2P20248 432 aa14.96□□□□□ -0.01
THBS3-207ENST00000486260 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
THBS3-207ENST00000486260 DLX5P56178 289 aa14.96□□□□□ -0.01
THBS3-207ENST00000486260 RIPK1Q13546 671 aa14.96□□□□□ -0.01
THBS3-207ENST00000486260 DGCR6Q14129 220 aa14.96□□□□□ -0.01
THBS3-207ENST00000486260 TRAM2Q15035 370 aa14.96□□□□□ -0.01
THBS3-207ENST00000486260 FGD3Q5JSP0 725 aa14.96□□□□□ -0.01
THBS3-207ENST00000486260 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
THBS3-207ENST00000486260 RAET1LQ5VY80 246 aa14.96□□□□□ -0.01
THBS3-207ENST00000486260 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa14.96□□□□□ -0.01
THBS3-207ENST00000486260 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
THBS3-207ENST00000486260 OR14L1PQ8NHC6 308 aa14.96□□□□□ -0.01
THBS3-207ENST00000486260 PNPLA2Q96AD5 504 aa14.96□□□□□ -0.01
THBS3-207ENST00000486260 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
THBS3-207ENST00000486260 MRGPRX4Q96LA9 322 aa14.96□□□□□ -0.01
THBS3-207ENST00000486260 TAAR6Q96RI8 345 aa14.96□□□□□ -0.01
THBS3-207ENST00000486260 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
THBS3-207ENST00000486260 BDH2Q9BUT1 245 aa14.96□□□□□ -0.01
THBS3-207ENST00000486260 OR2B2Q9GZK3 357 aa14.96□□□□□ -0.01
THBS3-207ENST00000486260 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
THBS3-207ENST00000486260 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
THBS3-207ENST00000486260 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa14.96□□□□□ -0.02
THBS3-207ENST00000486260 ATP6V1G2O95670 118 aa14.96□□□□□ -0.02
THBS3-207ENST00000486260 HPNP05981 417 aa14.96□□□□□ -0.02
THBS3-207ENST00000486260 FREM3P0C091 2139 aa14.96□□□□□ -0.02
THBS3-207ENST00000486260 EIF1P41567 113 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
THBS3-207ENST00000486260 HTR3AP46098 478 aa14.96□□□□□ -0.02
THBS3-207ENST00000486260 HMGA2P52926 109 aa14.96□□□□□ -0.02
THBS3-207ENST00000486260 SMIM11AP58511 58 aa14.96□□□□□ -0.02
THBS3-207ENST00000486260 LAPTM4AQ15012 233 aa14.96□□□□□ -0.02
THBS3-207ENST00000486260 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa14.96□□□□□ -0.02
THBS3-207ENST00000486260 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
THBS3-207ENST00000486260 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
THBS3-207ENST00000486260 LINC00114Q6XXX2 140 aa14.96□□□□□ -0.02
THBS3-207ENST00000486260 ADGRG3Q86Y34 549 aa14.96□□□□□ -0.02
THBS3-207ENST00000486260 FAM109AQ8N4B1 249 aa14.96□□□□□ -0.02
THBS3-207ENST00000486260 ICA1LQ8NDH6 482 aa14.96□□□□□ -0.02
THBS3-207ENST00000486260 OR4C15Q8NGM1 316 aa14.96□□□□□ -0.02
THBS3-207ENST00000486260 SLC7A13Q8TCU3 470 aa14.96□□□□□ -0.02
THBS3-207ENST00000486260 TMEM255BQ8WV15 326 aa14.96□□□□□ -0.02
THBS3-207ENST00000486260 ALPK1Q96QP1 1244 aa14.96□□□□□ -0.02
THBS3-207ENST00000486260 SLC25A18Q9H1K4 315 aa14.96□□□□□ -0.02
THBS3-207ENST00000486260 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa14.96□□□□□ -0.02
THBS3-207ENST00000486260 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
THBS3-207ENST00000486260 A0A087WUJ7 227 aa14.95□□□□□ -0.02
THBS3-207ENST00000486260 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa14.95□□□□□ -0.02
THBS3-207ENST00000486260 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
THBS3-207ENST00000486260 ERVH48-1M5A8F1 160 aa14.95□□□□□ -0.02
THBS3-207ENST00000486260 EFNA2O43921 213 aa14.95□□□□□ -0.02
THBS3-207ENST00000486260 E2F6O75461 281 aa14.95□□□□□ -0.02
THBS3-207ENST00000486260 PNMTP11086 282 aa14.95□□□□□ -0.02
THBS3-207ENST00000486260 ZNF24P17028 368 aa14.95□□□□□ -0.02
THBS3-207ENST00000486260 IL11P20809 199 aa14.95□□□□□ -0.02
THBS3-207ENST00000486260 CXCR1P25024 350 aa14.95□□□□□ -0.02
THBS3-207ENST00000486260 ADH6P28332 368 aa14.95□□□□□ -0.02
THBS3-207ENST00000486260 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
THBS3-207ENST00000486260 LIMS1P48059 325 aa14.95□□□□□ -0.02
THBS3-207ENST00000486260 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP14.95□□□□□ -0.02
THBS3-207ENST00000486260 LY6DQ14210 128 aa14.95□□□□□ -0.02
THBS3-207ENST00000486260 SLC10A1Q14973 349 aa14.95□□□□□ -0.02
THBS3-207ENST00000486260 SEC23BQ15437 767 aa14.95□□□□□ -0.02
THBS3-207ENST00000486260 TMEM44Q2T9K0 475 aa14.95□□□□□ -0.02
THBS3-207ENST00000486260 ELOA3BQ3SY89 546 aa14.95□□□□□ -0.02
THBS3-207ENST00000486260 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
THBS3-207ENST00000486260 DCST1Q5T197 706 aa14.95□□□□□ -0.02
THBS3-207ENST00000486260 PODNL1Q6PEZ8 512 aa14.95□□□□□ -0.02
THBS3-207ENST00000486260 TBPL2Q6SJ96 375 aa14.95□□□□□ -0.02
THBS3-207ENST00000486260 P3H2Q8IVL5 708 aa14.95□□□□□ -0.02
THBS3-207ENST00000486260 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
THBS3-207ENST00000486260 Q8NA96 180 aa14.95□□□□□ -0.02
THBS3-207ENST00000486260 ELOA3Q8NG57 546 aa14.95□□□□□ -0.02
THBS3-207ENST00000486260 DTNBP1Q96EV8 351 aa14.95□□□□□ -0.02
THBS3-207ENST00000486260 MPP4Q96JB8 637 aa14.95□□□□□ -0.02
THBS3-207ENST00000486260 EPYCQ99645 322 aa14.95□□□□□ -0.02
THBS3-207ENST00000486260 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
THBS3-207ENST00000486260 FUZQ9BT04 418 aa14.95□□□□□ -0.02
THBS3-207ENST00000486260 DEFB127Q9H1M4 99 aa14.95□□□□□ -0.02
THBS3-207ENST00000486260 C12orf10Q9HB07 376 aa14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms