RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484918.1

MRPL23-209, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L23, human

TSL 5

Gene MRPL23, Length 232 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL23-209	ENST00000484918	C3orf30	Q96M34	536 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MRPL23-209	ENST00000484918	KCNC2	Q96PR1	638 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MRPL23-209	ENST00000484918	SPATA25	Q9BR10	227 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MRPL23-209	ENST00000484918	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
MRPL23-209	ENST00000484918	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MRPL23-209	ENST00000484918	ASPN	Q9BXN1	380 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MRPL23-209	ENST00000484918	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MRPL23-209	ENST00000484918	POFUT1	Q9H488	388 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MRPL23-209	ENST00000484918	RMND5A	Q9H871	391 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MRPL23-209	ENST00000484918	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MRPL23-209	ENST00000484918	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MRPL23-209	ENST00000484918	SDHAF3	Q9NRP4	125 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MRPL23-209	ENST00000484918	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MRPL23-209	ENST00000484918	MED17	Q9NVC6	651 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MRPL23-209	ENST00000484918	DSPP	Q9NZW4	1301 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MRPL23-209	ENST00000484918	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MRPL23-209	ENST00000484918	ZNF639	Q9UID6	485 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MRPL23-209	ENST00000484918	RIMKLB	Q9ULI2	386 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MRPL23-209	ENST00000484918	FZR1	Q9UM11	496 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MRPL23-209	ENST00000484918	CFL2	Q9Y281	166 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MRPL23-209	ENST00000484918	MED16	Q9Y2X0	877 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MRPL23-209	ENST00000484918	NOSIP	Q9Y314	301 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
MRPL23-209	ENST00000484918	PLLP	Q9Y342	182 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MRPL23-209	ENST00000484918	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MRPL23-209	ENST00000484918	NPTN	Q9Y639	398 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MRPL23-209	ENST00000484918	NR5A2	O00482	541 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MRPL23-209	ENST00000484918	RTL8C	O15255	209 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MRPL23-209	ENST00000484918	SHOX	O15266	292 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MRPL23-209	ENST00000484918	WNT2	P09544	360 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MRPL23-209	ENST00000484918	SBK2	P0C263	348 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MRPL23-209	ENST00000484918	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
MRPL23-209	ENST00000484918	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
MRPL23-209	ENST00000484918	GSTM2	P28161	218 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MRPL23-209	ENST00000484918	IL12B	P29460	328 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MRPL23-209	ENST00000484918	GLRX	P35754	106 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MRPL23-209	ENST00000484918	GRIA1	P42261	906 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MRPL23-209	ENST00000484918	DYNLT1	P63172	113 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MRPL23-209	ENST00000484918	GALK2	Q01415	458 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MRPL23-209	ENST00000484918	PDK3	Q15120	406 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MRPL23-209	ENST00000484918	RABEP1	Q15276	862 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MRPL23-209	ENST00000484918	FXN	Q16595	210 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MRPL23-209	ENST00000484918	MSS51	Q4VC12	460 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MRPL23-209	ENST00000484918	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MRPL23-209	ENST00000484918	DUPD1	Q68J44	220 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MRPL23-209	ENST00000484918	TMIGD1	Q6UXZ0	262 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MRPL23-209	ENST00000484918	NPSR1	Q6W5P4	371 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MRPL23-209	ENST00000484918	CCDC121	Q6ZUS5	278 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MRPL23-209	ENST00000484918	MARCH3	Q86UD3	253 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MRPL23-209	ENST00000484918	LRRC28	Q86X40	367 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
MRPL23-209	ENST00000484918	VSIG1	Q86XK7	387 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MRPL23-209	ENST00000484918	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MRPL23-209	ENST00000484918	ZFP90	Q8TF47	636 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MRPL23-209	ENST00000484918	WDR34	Q96EX3	536 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MRPL23-209	ENST00000484918	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MRPL23-209	ENST00000484918	QKI	Q96PU8	341 aa	Known RBP eCLIP	5.09	□□□□□ -1.59
MRPL23-209	ENST00000484918	PITX2	Q99697	317 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MRPL23-209	ENST00000484918	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
MRPL23-209	ENST00000484918	ROGDI	Q9GZN7	287 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MRPL23-209	ENST00000484918	NELFA	Q9H3P2	528 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MRPL23-209	ENST00000484918	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MRPL23-209	ENST00000484918	HINT3	Q9NQE9	182 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
MRPL23-209	ENST00000484918	MS4A12	Q9NXJ0	267 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MRPL23-209	ENST00000484918	SCOC	Q9UIL1	159 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MRPL23-209	ENST00000484918	CRYL1	Q9Y2S2	319 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MRPL23-209	ENST00000484918	MAB21L2	Q9Y586	359 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MRPL23-209	ENST00000484918	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
MRPL23-209	ENST00000484918		A0A1W2PNR3	127 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MRPL23-209	ENST00000484918	GLOD5	A6NK44	160 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MRPL23-209	ENST00000484918	AQP7P3	A6NL99	342 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MRPL23-209	ENST00000484918		H3BMM5	538 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MRPL23-209	ENST00000484918	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
MRPL23-209	ENST00000484918	NDUFS3	O75489	264 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MRPL23-209	ENST00000484918	CTNNA2	P26232	953 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MRPL23-209	ENST00000484918	ELK4	P28324	431 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MRPL23-209	ENST00000484918	GP5	P40197	560 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MRPL23-209	ENST00000484918	NR2C2	P49116	596 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MRPL23-209	ENST00000484918	THBS3	P49746	956 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MRPL23-209	ENST00000484918	CORO7	P57737	925 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MRPL23-209	ENST00000484918	SLC3A1	Q07837	685 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MRPL23-209	ENST00000484918	DHX9	Q08211	1270 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
MRPL23-209	ENST00000484918	MFGE8	Q08431	387 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
MRPL23-209	ENST00000484918	E2F2	Q14209	437 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MRPL23-209	ENST00000484918	NPTX1	Q15818	432 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MRPL23-209	ENST00000484918	TMEM176B	Q3YBM2	270 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
MRPL23-209	ENST00000484918	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MRPL23-209	ENST00000484918	APOOL	Q6UXV4	268 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MRPL23-209	ENST00000484918	RNF165	Q6ZSG1	346 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MRPL23-209	ENST00000484918	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MRPL23-209	ENST00000484918	CDYL2	Q8N8U2	506 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MRPL23-209	ENST00000484918	SCCPDH	Q8NBX0	429 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MRPL23-209	ENST00000484918	OR4N2	Q8NGD1	307 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MRPL23-209	ENST00000484918	ITLN1	Q8WWA0	313 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MRPL23-209	ENST00000484918	SLC9A6	Q92581	669 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MRPL23-209	ENST00000484918	TSPAN32	Q96QS1	320 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MRPL23-209	ENST00000484918	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MRPL23-209	ENST00000484918	SORBS1	Q9BX66	1292 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
MRPL23-209	ENST00000484918	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MRPL23-209	ENST00000484918	MUC13	Q9H3R2	512 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MRPL23-209	ENST00000484918	C10orf88	Q9H8K7	445 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MRPL23-209	ENST00000484918	ETNK1	Q9HBU6	452 aa		5.08	□□□□□ -1.6

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms