RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484097.1

SH3BP4-209, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 612 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP17.27■□□□□ 0.36
SH3BP4-209ENST00000484097 GMEB1Q9Y692 573 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP4-209ENST00000484097 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 TUBAL3A6NHL2 446 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 PGM3O95394 542 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 ARAFP10398 606 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 SLC6A2P23975 617 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 CPOXP36551 454 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 RAC3P60763 192 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 COPZ1P61923 177 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 CDK6Q00534 326 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 MMEL1Q495T6 779 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 CGB2Q6NT52 195 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 REEP3Q6NUK4 255 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF836Q6ZNA1 936 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF550Q7Z398 422 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 KRT73Q86Y46 540 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 NFKBIDQ8NI38 313 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 CGREF1Q99674 301 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 CCDC106Q9BWC9 280 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 SPATA9Q9BWV2 254 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 RLIMQ9NVW2 624 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 GALNT8Q9NY28 637 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 CHRNA9Q9UGM1 479 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 CDHR4A6H8M9 788 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 FAAHO00519 579 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 AP3D1O14617 1153 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 GKN3PP0CG01 181 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 CCNA2P20248 432 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 KCNJ5P48544 419 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 SORDQ00796 357 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 EPS8Q12929 822 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 MAPRE2Q15555 327 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 SYT14P1Q58G82 188 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 RNF220Q5VTB9 566 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 FCRLAQ7L513 359 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 ZZZ3Q8IYH5 903 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 ANKRD27Q96NW4 1050 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 SLC39A3Q9BRY0 314 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 SRXN1Q9BYN0 137 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 COQ10BQ9H8M1 238 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 MCCC2Q9HCC0 563 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 PRDM4Q9UKN5 801 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 SULT2B1O00204 365 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 ADAM11O75078 769 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 PRKD3O94806 890 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 CD8BP10966 210 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 ETS2P15036 469 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 ENPP1P22413 925 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 SLC1A3P43003 542 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 PLAURQ03405 335 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 KLF10Q13118 480 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 SCARB2Q14108 478 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 TMEM201Q5SNT2 666 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 TMPPEQ6ZT21 453 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 RETREG3Q86VR2 466 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 ADGRG3Q86Y34 549 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 SLC43A2Q8N370 569 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 CLIP4Q8N3C7 705 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF610Q8N9Z0 462 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 OR6K3Q8NGY3 331 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 FAM222BQ8WU58 562 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF607Q96SK3 696 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 IKZF5Q9H5V7 419 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 TMEM38AQ9H6F2 299 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 SAR1AQ9NR31 198 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 ELOVL5Q9NYP7 299 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 CRIM1Q9NZV1 1036 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 TMED7Q9Y3B3 224 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 UNC79Q9P2D8 2635 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 CELSR2Q9HCU4 2923 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 TACR3P29371 465 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 CLK1P49759 484 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 GUSBP1Q15486 140 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 TMEM200AQ86VY9 491 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 CADM2Q8N3J6 435 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 LINC01560Q8TB33 94 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 RNF128Q8TEB7 428 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 DDIT4LQ96D03 193 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 FANCFQ9NPI8 374 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 NDRG3Q9UGV2 375 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 OSGIN1Q9UJX0 560 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 ANGPT4Q9Y264 503 aa17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.4 ms