RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483765.5

RPL21-208, Transcript of ribosomal protein L21, human

TSL 3

Gene RPL21, Length 453 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPL21-208	ENST00000483765	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	FBXW2	Q9UKT8	454 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	MRPS2	Q9Y399	296 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	ZNF469	Q96JG9	3925 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	NUP210	Q8TEM1	1887 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	SMIM30	A4D0T7	59 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765		H0YHG0	523 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	JAK2	O60674	1132 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	FMO6P	O60774	539 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	RTN2	O75298	545 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	ERLIN2	O94905	339 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	KLF8	O95600	359 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	CHML	P26374	656 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	GABRR2	P28476	465 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	CASP3	P42574	277 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	TUFM	P49411	452 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	KLRB1	Q12918	225 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	ZNF77	Q15935	545 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	PPP1R3A	Q16821	1122 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	XKR4	Q5GH76	650 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	CENPP	Q6IPU0	288 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	TMEM270	Q6UE05	265 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	B3GLCT	Q6Y288	498 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	PAXX	Q9BUH6	204 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	NUP58	Q9BVL2	599 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	DUS2	Q9NX74	493 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	TAS2R16	Q9NYV7	291 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	RSPH14	Q9UHP6	348 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	KIAA1549L	Q6ZVL6	1849 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	MYH7	P12883	1935 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	LRRK1	Q38SD2	2015 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	CROCC	Q5TZA2	2017 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	C5orf51	A6NDU8	294 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	C10orf142	B7Z368	130 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	SLC9A3R1	O14745	358 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	NVL	O15381	856 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	GOT2	P00505	430 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	IGHV3-9	P01782	118 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	APOD	P05090	189 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	CD82	P27701	267 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	IFNAR2	P48551	515 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	ARRB1	P49407	418 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	CSNK1E	P49674	416 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	MEOX2	P50222	304 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	ARHGDIA	P52565	204 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	ZNF131	P52739	623 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	KRTAP12-2	P59991	146 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	IGLV3-21	P80748	117 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	PRKCE	Q02156	737 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	WASHC5	Q12768	1159 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	EXOSC7	Q15024	291 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	MICA	Q29983	383 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	ISX	Q2M1V0	245 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	ACER2	Q5QJU3	275 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	FAM219B	Q5XKK7	198 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	IYD	Q6PHW0	289 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	TMEM150A	Q86TG1	271 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	SLC22A16	Q86VW1	577 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	LINC00518	Q8N0U6	118 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	C2orf15	Q8WU43	125 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	C17orf50	Q8WW18	174 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	BIRC7	Q96CA5	298 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	OTUB2	Q96DC9	234 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	RIT2	Q99578	217 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	IMPAD1	Q9NX62	359 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765		Q9UF83	564 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	EMCN	Q9ULC0	261 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	TMCC3	Q9ULS5	477 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	MYLK	Q15746	1914 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	FAM170A	A1A519	330 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	FAM25E	A8MYX2	175 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	TMX2-CTNND1	H3BSU7	103 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	CHEK1	O14757	476 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	ARPC1B	O15143	372 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	E2F6	O75461	281 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	NUDT14	O95848	222 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPL21-208	ENST00000483765	LY6G6D	O95868	133 aa		3.35	□□□□□ -1.87

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