RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481849.5

HLA-B-253, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, human

Gene HLA-B, Length 753 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HLA-B-253	ENST00000481849	SLC7A1	P30825	629 aa		7.99	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	LCN1	P31025	176 aa		7.99	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	ARRB2	P32121	409 aa		7.99	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	7.99	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	EIF1	P41567	113 aa	Known RBP	7.99	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	P2RX1	P51575	399 aa		7.99	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	CASP9	P55211	416 aa		7.99	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	ATP5J2	P56134	94 aa		7.99	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	AKAP6	Q13023	2319 aa		7.99	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	MLC1	Q15049	377 aa		7.99	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	ZNF124	Q15973	351 aa		7.99	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	ATP6AP1L	Q52LC2	224 aa		7.99	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	KLHL26	Q53HC5	615 aa		7.99	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	C6orf136	Q5SQH8	315 aa		7.99	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	TFAP2E	Q6VUC0	442 aa		7.99	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	RNF165	Q6ZSG1	346 aa		7.99	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	FCRLA	Q7L513	359 aa		7.99	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	7.99	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	BANP	Q8N9N5	519 aa		7.99	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	ZNF527	Q8NB42	609 aa		7.99	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	MAPK1IP1L	Q8NDC0	245 aa		7.99	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	STEAP2	Q8NFT2	490 aa		7.99	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	OR56A1	Q8NGH5	318 aa		7.99	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	TCP10L	Q8TDR4	215 aa		7.99	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	NEUROG1	Q92886	237 aa		7.99	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	CPNE4	Q96A23	557 aa	Predicted RBP	7.99	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	TUBGCP3	Q96CW5	907 aa		7.99	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	PPP1R36	Q96LQ0	422 aa		7.99	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	OR7D2	Q96RA2	312 aa		7.99	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	HOXD1	Q9GZZ0	328 aa		7.99	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	QRSL1	Q9H0R6	528 aa	Known RBP	7.99	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		7.99	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	COQ10B	Q9H8M1	238 aa		7.99	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		7.99	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	ATAD3A	Q9NVI7	634 aa		7.99	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	GPATCH2	Q9NW75	528 aa		7.99	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		7.99	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	ZDHHC2	Q9UIJ5	367 aa		7.99	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	ICAM5	Q9UMF0	924 aa		7.99	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849		U3KQE9	123 aa		7.99	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	CENPVL1	A0A0U1RR11	272 aa		7.98	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	GCM2	O75603	506 aa	Predicted RBP	7.98	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	PRKD3	O94806	890 aa		7.98	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	G6PD	P11413	515 aa		7.98	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	UBL4A	P11441	157 aa		7.98	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	CREB1	P16220	341 aa		7.98	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	PRKCA	P17252	672 aa		7.98	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	7.98	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	ELK4	P28324	431 aa		7.98	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	CDKN1A	P38936	164 aa		7.98	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	ATP12A	P54707	1039 aa		7.98	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	RPS4X	P62701	263 aa	Known RBP	7.98	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	PPP2R2B	Q00005	443 aa		7.98	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	IFFO1	Q0D2I5	559 aa		7.98	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	VEZF1	Q14119	521 aa		7.98	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	QPRT	Q15274	297 aa		7.98	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	7.98	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	GPR68	Q15743	365 aa		7.98	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	TAB1	Q15750	504 aa		7.98	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	STK11	Q15831	433 aa		7.98	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	7.98	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	XKR7	Q5GH72	579 aa		7.98	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	PDZK1	Q5T2W1	519 aa		7.98	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		7.98	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	7.98	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	CLECL1	Q8IZS7	167 aa		7.98	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	ZNF611	Q8N823	705 aa		7.98	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	EIF1AD	Q8N9N8	165 aa	Known RBP	7.98	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	STK35	Q8TDR2	534 aa		7.98	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	GPR119	Q8TDV5	335 aa		7.98	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	ZFP90	Q8TF47	636 aa		7.98	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		7.98	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	KISS1R	Q969F8	398 aa	Predicted RBP	7.98	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	ZBTB9	Q96C00	473 aa		7.98	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	DNAJA3	Q96EY1	480 aa		7.98	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	OR5B2	Q96R09	309 aa		7.98	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	7.98	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		7.98	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	THUMPD3	Q9BV44	507 aa	Known RBP	7.98	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	DUSP26	Q9BV47	211 aa		7.98	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	PRSS50	Q9UI38	385 aa		7.98	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		7.98	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	RNF115	Q9Y4L5	304 aa		7.98	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	WDR91	A4D1P6	747 aa		7.97	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	SERINC4	A6NH21	518 aa		7.97	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		7.97	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	NPIPB9	F8W1W9	429 aa		7.97	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	ZNF264	O43296	627 aa		7.97	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	FCMR	O60667	390 aa		7.97	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	LYPLA1	O75608	230 aa	Predicted RBP	7.97	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	LYZL6	O75951	148 aa		7.97	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	H6PD	O95479	791 aa		7.97	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	CD3E	P07766	207 aa		7.97	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	YES1	P07947	543 aa		7.97	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	SOD3	P08294	240 aa		7.97	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	KRT16	P08779	473 aa		7.97	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	7.97	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	PTN	P21246	168 aa		7.97	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	EDNRA	P25101	427 aa		7.97	□□□□□ -1.13
HLA-B-253	ENST00000481849	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	7.97	□□□□□ -1.13

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