RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479054.5

NISCH-207, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,173 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-207ENST00000479054 TNFRSF10AO00220 468 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 AIFM1O95831 613 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 CRHBPP24387 322 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 CXCR4P61073 352 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 ODF4Q2M2E3 257 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 ZNF691Q5VV52 312 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 SLC22A10Q63ZE4 541 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 SLC37A2Q8TED4 501 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 IL20RAQ9UHF4 553 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 SLC19A2O60779 497 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 PEX14O75381 377 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 DDAH2O95865 285 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 MSX1P28360 303 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 CYB561P49447 251 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 CCL11P51671 97 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 OR7A5Q15622 319 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 PYCR3Q53H96 274 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 FAM205BPQ63HN1 556 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 OR5T2Q8NGG2 359 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 PRRC1Q96M27 445 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 VN1R3Q9BXE9 311 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 TAS2R3Q9NYW6 316 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 TRIP11Q15643 1979 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 GPR171O14626 319 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 OLFM2O95897 454 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 SLC35E2P0CK97 266 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 FUT1P19526 365 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 STOML3Q8TAV4 291 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 TMEM239Q8WW34 195 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 CDS1Q92903 461 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 MED30Q96HR3 178 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 SLC35F4A4IF30 521 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 C5orf51A6NDU8 294 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 LCATP04180 440 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 C17orf67Q0P5P2 114 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 C4orf46Q504U0 113 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 FRMPD2BQ6IN97 320 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 NAXEQ8NCW5 288 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 OR7D2Q96RA2 312 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 DNTTIP1Q9H147 329 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 BEX1Q9HBH7 125 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 FAM86C1Q9NVL1 165 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 SLC7A7Q9UM01 511 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 OR51B4Q9Y5P0 310 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 CCDC187A0A096LP49 1063 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 A0A1B0GTL3 188 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 MKRN2OSH3BPM6 223 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 PCDH17O14917 1159 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 ICMTO60725 284 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 DIRAS3O95661 229 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 IGHG1P01857 330 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 ITGB2P05107 769 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 UGT2B10P36537 528 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 SLC35A1P78382 337 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 ZP2Q05996 745 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 NHSL2Q5HYW2 709 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 ABHD5Q8WTS1 349 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 SLC38A5Q8WUX1 472 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 PDXPQ96GD0 296 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 COQ10AQ96MF6 247 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 SLC5A7Q9GZV3 580 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 SLC6A17Q9H1V8 727 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 OR10A5Q9H207 317 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 OR10A2Q9H208 303 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 FGF22Q9HCT0 170 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 CHRFAM7AQ494W8 412 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 FAM122CQ6P4D5 195 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 OR9K2Q8NGE7 335 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 LYRM4Q9HD34 91 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 PYCR1P32322 319 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 CSNK1G2P78368 415 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 BDH1Q02338 343 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 NKAPLQ5M9Q1 402 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 AGAP6Q5VW22 663 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 C22orf42Q6IC83 251 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 TM4SF18Q96CE8 201 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 AGAP4Q96P64 663 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 FAM117AQ9C073 453 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 OR10A4Q9H209 315 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-207ENST00000479054 PPT2Q9UMR5 302 aa12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms