RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477970.1

PTPRF-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRF, Length 3,321 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-212ENST00000477970 MT-ND5P03915 603 aa11.23□□□□□ -0.61
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PTPRF-212ENST00000477970 LCN1P1Q5VSP4 162 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRF-212ENST00000477970 FAM131AQ6UXB0 335 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRF-212ENST00000477970 AKAP14Q86UN6 197 aa11.22□□□□□ -0.61
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PTPRF-212ENST00000477970 TMEM43Q9BTV4 400 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRF-212ENST00000477970 TPK1Q9H3S4 243 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRF-212ENST00000477970 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
PTPRF-212ENST00000477970 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
PTPRF-212ENST00000477970 CUL9Q8IWT3 2517 aa11.21□□□□□ -0.61
PTPRF-212ENST00000477970 TRAV27A0A087WT01 109 aa11.21□□□□□ -0.61
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