RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477563.6

RBBP4-211, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, humanhuman

TSL 5

Gene RBBP4, Length 544 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4-211ENST00000477563 MED11Q9P086 117 aa6.8□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 GIMAP2Q9UG22 337 aa6.8□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 PCDHGB4Q9UN71 923 aa6.8□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 SNX8Q9Y5X2 465 aa6.8□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 GPR45Q9Y5Y3 372 aa6.8□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa6.79□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 A0A1W2PP18 115 aa6.79□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 NPIPB9F8W1W9 429 aa6.79□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 H3BNH8 94 aa6.79□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 SCDO00767 359 aa6.79□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 ZNF195O14628 629 aa6.79□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 GPRIN2O60269 458 aa6.79□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 ANGPTL1O95841 491 aa6.79□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 C6orf47O95873 294 aa6.79□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 PGRP06401 933 aa6.79□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 FESP07332 822 aa6.79□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 CD3EP07766 207 aa6.79□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 ZCCHC18P0CG32 403 aa6.79□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 UQCRC2P22695 453 aa6.79□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 ELK4P28324 431 aa6.79□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 AGTR1P30556 359 aa6.79□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 CTBP2P56545 445 aa6.79□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 RAC1P63000 192 aa6.79□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 SGCBQ16585 318 aa6.79□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 DCST2Q5T1A1 773 aa6.79□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 SFRP5Q5T4F7 317 aa6.79□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa6.79□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa6.79□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa6.79□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa6.79□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 OR5M1Q8NGP8 315 aa6.79□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 OR10D3Q8NH80 312 aa6.79□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 LRRC8CQ8TDW0 803 aa6.79□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 ADAMTS15Q8TE58 950 aa6.79□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 DUSP19Q8WTR2 217 aa6.79□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 SLC9A6Q92581 669 aa6.79□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 S100PBPQ96BU1 408 aa6.79□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 NEURL3Q96EH8 262 aa6.79□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 ZBTB18Q99592 522 aa6.79□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 RHNO1Q9BSD3 238 aa6.79□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 C19orf24Q9BVV8 132 aa6.79□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa6.79□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 GP6Q9HCN6 339 aa6.79□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 EQTNQ9NQ60 294 aa6.79□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 MRGBPQ9NV56 204 aa6.79□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 EXD2Q9NVH0 621 aa6.79□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 PNPOQ9NVS9 261 aa6.79□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa6.79□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP6.78□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa6.78□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 GXYLT2A0PJZ3 443 aa6.78□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 DPRXA6NFQ7 191 aa6.78□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 CFLARO15519 480 aa6.78□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 NDUFB5O43674 189 aa6.78□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 SCO2O43819 266 aa6.78□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 KIAA0513O60268 411 aa6.78□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 DNAJA2O60884 412 aa6.78□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 NDUFS7O75251 213 aa6.78□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 NME6O75414 186 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 PLGP00747 810 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 IGKV1D-16P01601 117 aa6.78□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 HPGDP15428 266 aa6.78□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 ATP6V1C1P21283 382 aa6.78□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 EPHA3P29320 983 aa6.78□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 S100A3P33764 101 aa6.78□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 EIF1P41567 113 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 KHKP50053 298 aa6.78□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 PRKAG1P54619 331 aa6.78□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 ATP12AP54707 1039 aa6.78□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 TAB1Q15750 504 aa6.78□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 ZNF141Q15928 474 aa6.78□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 GRAMD1BQ3KR37 738 aa6.78□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa6.78□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa6.78□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 SPDYE7PQ495Y7 208 aa6.78□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 KLHL26Q53HC5 615 aa6.78□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 TTMPQ5BVD1 217 aa6.78□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 SPANXN4Q5MJ08 99 aa6.78□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 ATAD3BQ5T9A4 648 aa6.78□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 SAXO2Q658L1 398 aa6.78□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 OR4F3Q6IEY1 312 aa6.78□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 C11orf71Q6IPW1 123 aa6.78□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 FIGNL1Q6PIW4 674 aa6.78□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 APOOLQ6UXV4 268 aa6.78□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 SSX8Q7RTT4 187 aa6.78□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 SZRD1Q7Z422 152 aa6.78□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 GALNT10Q86SR1 603 aa6.78□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 RNF128Q8TEB7 428 aa6.78□□□□□ -1.32
RBBP4-211ENST00000477563 PIK3R3Q92569 461 aa6.78□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.5 ms