RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466636.1

SRPRB-202, Transcript of SRP receptor subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene SRPRB, Length 917 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRB-202ENST00000466636 RPS15P62841 145 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 FHL1Q13642 323 aa8.7□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 SSPNQ14714 243 aa8.7□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 NTRK2Q16620 822 aa8.7□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 SWI5Q1ZZU3 235 aa8.7□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 CASP12Q6UXS9 341 aa8.7□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 PTCHD4Q6ZW05 846 aa8.7□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 TMPRSS12Q86WS5 348 aa8.7□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 P3H2Q8IVL5 708 aa8.7□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 SPARTQ8N0X7 666 aa8.7□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 OR8J1Q8NGP2 316 aa8.7□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 OR5M3Q8NGP4 307 aa8.7□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 OR13C2Q8NGS9 318 aa8.7□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 OR4Q3Q8NH05 313 aa8.7□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa8.7□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 OSTF1Q92882 214 aa8.7□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 NACC2Q96BF6 587 aa8.7□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 SAMD8Q96LT4 415 aa8.7□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 SIGLEC11Q96RL6 698 aa8.7□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 RHNO1Q9BSD3 238 aa8.7□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 TSSK6Q9BXA6 273 aa8.7□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 GPR87Q9BY21 358 aa8.7□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 SLC19A3Q9BZV2 496 aa8.7□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 FAM192AQ9GZU8 254 aa8.7□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 ADAM19Q9H013 955 aa8.7□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 ZNF160Q9HCG1 818 aa8.7□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 TBC1D23Q9NUY8 699 aa8.7□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 SCN3BQ9NY72 215 aa8.7□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 ERVK-18Q9QC07 812 aa8.7□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa8.7□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 SIGLEC7Q9Y286 467 aa8.7□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 HRH3Q9Y5N1 445 aa8.7□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa8.69□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa8.69□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa8.69□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 SH3D21A4FU49 640 aa8.69□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 HTR3EA5X5Y0 456 aa8.69□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 B4DXG7 233 aa8.69□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 PTGES3LE9PB15 166 aa8.69□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 MASP2O00187 686 aa8.69□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 GNB5O14775 395 aa8.69□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 TM4SF5O14894 197 aa8.69□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 PRKYO43930 277 aa8.69□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 MAN1A2O60476 641 aa8.69□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 PTP4A3O75365 173 aa8.69□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 PGCP20142 388 aa8.69□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 TACR3P29371 465 aa8.69□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 DLSTP36957 453 aa8.69□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 SOX3P41225 446 aa8.69□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 SLC1A3P43003 542 aa8.69□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 NUDT6P53370 316 aa8.69□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 DLX5P56178 289 aa8.69□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 Q0VFX4 171 aa8.69□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 CHAF1BQ13112 559 aa8.69□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 IL10RAQ13651 578 aa8.69□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 CBFBQ13951 182 aa8.69□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 QPRTQ15274 297 aa8.69□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 OCLNQ16625 522 aa8.69□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 COL28A1Q2UY09 1125 aa8.69□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 PGGHGQ32M88 737 aa8.69□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 ELOA3BQ3SY89 546 aa8.69□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa8.69□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 SLC25A30Q5SVS4 291 aa8.69□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 XAF1Q6GPH4 301 aa8.69□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa8.69□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 SLC27A4Q6P1M0 643 aa8.69□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 KCTD8Q6ZWB6 473 aa8.69□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa8.69□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 MARCH9Q86YJ5 346 aa8.69□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 CDK20Q8IZL9 346 aa8.69□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 FAM26EQ8N5C1 309 aa8.69□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 TCEANCQ8N8B7 351 aa8.69□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 ELOA3Q8NG57 546 aa8.69□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 OR10G3Q8NGC4 313 aa8.69□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 FANK1Q8TC84 345 aa8.69□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 GPR119Q8TDV5 335 aa8.69□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 DUSP19Q8WTR2 217 aa8.69□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 GGHQ92820 318 aa8.69□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 TMIGD2Q96BF3 282 aa8.69□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 NTNG2Q96CW9 530 aa8.69□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 SGTBQ96EQ0 304 aa8.69□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 IL4I1Q96RQ9 567 aa8.69□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 TMEM43Q9BTV4 400 aa8.69□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 OR52D1Q9H346 318 aa8.69□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 UBQLN3Q9H347 655 aa8.69□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa8.69□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 CLN6Q9NWW5 311 aa8.69□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 TVP23BQ9NYZ1 205 aa8.69□□□□□ -1.02
SRPRB-202ENST00000466636 NDUFA13Q9P0J0 144 aa8.69□□□□□ -1.02
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