RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461327.5

RRM2-204, Transcript of ribonucleotide reductase regulatory subunit M2, human

TSL 2

Gene RRM2, Length 580 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRM2-204	ENST00000461327	TMEM114	B3SHH9	223 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	ANGPTL1	O95841	491 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	IGHV3-9	P01782	118 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	BMP4	P12644	408 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	ZNF17	P17021	662 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	BGN	P21810	368 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	NTS	P30990	170 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	MAP3K8	P41279	467 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	SHQ1	Q6PI26	577 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	APOOL	Q6UXV4	268 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	FCRLA	Q7L513	359 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	ZNF781	Q8N8C0	355 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	MTERF3	Q96E29	417 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	KLHL15	Q96M94	604 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	TBL1XR1	Q9BZK7	514 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	TAS2R9	Q9NYW1	312 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	NTM	Q9P121	344 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	ATP6V1H	Q9UI12	483 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	HAO1	Q9UJM8	370 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	ABCG2	Q9UNQ0	655 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	EPB41L3	Q9Y2J2	1087 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	ATP6V1G2-DDX39B	F2Z307	99 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	LILRA1	O75019	489 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	ERLIN1	O75477	346 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	HSPA4L	O95757	839 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	YES1	P07947	543 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	ME2	P23368	584 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	PTAFR	P25105	342 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	PSMA4	P25789	261 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	ASMT	P46597	345 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	OR3A2	P47893	321 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	SLC1A6	P48664	564 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	CHN2	P52757	468 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	RAC1	P63000	192 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	ZSWIM7	Q19AV6	140 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	MST1L	Q2TV78	715 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	PDSS1	Q5T2R2	415 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	IL23R	Q5VWK5	629 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	RIMKLA	Q8IXN7	391 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	GTPBP8	Q8N3Z3	284 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	MRPL24	Q96A35	216 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	PPCDC	Q96CD2	204 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	TLCD1	Q96CP7	247 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	USB1	Q9BQ65	265 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	TMBIM4	Q9HC24	238 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	FAM120C	Q9NX05	1096 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	RAP2C	Q9Y3L5	183 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	PDPK1	O15530	556 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	COQ9	O75208	318 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	PABPC4L	P0CB38	370 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	ARAF	P10398	606 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	ENPP1	P22413	925 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	SLC18A1	P54219	525 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	PTGR1	Q14914	329 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	GRAMD1B	Q3KR37	738 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	ATP6AP1L	Q52LC2	224 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	LILRA2	Q8N149	483 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	ZNF433	Q8N7K0	673 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	ATP6V1C2	Q8NEY4	427 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	OR7A2P	Q8NGA2	310 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	POC1B	Q8TC44	478 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	FAM110B	Q8TC76	370 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	ZNF300	Q96RE9	604 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	LMF2	Q9BU23	707 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	C1orf50	Q9BV19	199 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	ACSS1	Q9NUB1	689 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	GIMAP1-GIMAP5	A0A087WTJ2	511 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RRM2-204	ENST00000461327		A0A1W2PRB8	838 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RRM2-204	ENST00000461327	TMEM120B	A0PK00	339 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RRM2-204	ENST00000461327	SCAMP2	O15127	329 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RRM2-204	ENST00000461327	PRKD3	O94806	890 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RRM2-204	ENST00000461327	UTS2	O95399	124 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RRM2-204	ENST00000461327	MYZAP	P0CAP1	466 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RRM2-204	ENST00000461327	LAMP1	P11279	417 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RRM2-204	ENST00000461327	PRPS2	P11908	318 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RRM2-204	ENST00000461327	COX5A	P20674	150 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RRM2-204	ENST00000461327	EPHA1	P21709	976 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RRM2-204	ENST00000461327	MAPK1	P28482	360 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RRM2-204	ENST00000461327	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RRM2-204	ENST00000461327	RPL14	P50914	215 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RRM2-204	ENST00000461327	DVL1P1	P54792	670 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RRM2-204	ENST00000461327	PSPH	P78330	225 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RRM2-204	ENST00000461327	PHC1	P78364	1004 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RRM2-204	ENST00000461327	EMX2	Q04743	252 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RRM2-204	ENST00000461327	BST1	Q10588	318 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RRM2-204	ENST00000461327	HSPB3	Q12988	150 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RRM2-204	ENST00000461327	STX3	Q13277	289 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RRM2-204	ENST00000461327	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RRM2-204	ENST00000461327	SMU1	Q2TAY7	513 aa		13.52	□□□□□ -0.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms