RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	SYT5	O00445	386 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	EIF1AY	O14602	144 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	SEC14L5	O43304	696 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF208	O43345	1280 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	CTSS	P25774	331 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	RYK	P34925	604 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	ACAA2	P42765	397 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	IDH2	P48735	452 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	POLR2H	P52434	150 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	MERTK	Q12866	999 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	RABL3	Q5HYI8	236 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	WBP2NL	Q6ICG8	309 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	NCCRP1	Q6ZVX7	275 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	HMGN2P46	Q86SG4	172 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	ARMC8	Q8IUR7	673 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	TNIP2	Q8NFZ5	429 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	OR10D3	Q8NH80	312 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	SMPDL3B	Q92485	455 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	NPAS1	Q99742	590 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	ADAM19	Q9H013	955 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	KCNJ16	Q9NPI9	418 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	GLRX2	Q9NS18	164 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	RLIM	Q9NVW2	624 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	KLHL28	Q9NXS3	571 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	CHRNA9	Q9UGM1	479 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	MCTS1	Q9ULC4	181 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241		A0A0J9YW62	118 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	FAM220BP	B1ANY3	271 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	AIM2	O14862	343 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	DNPH1	O43598	174 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	EFNA2	O43921	213 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	ADAM11	O75078	769 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	MFN2	O95140	757 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	IFNA14	P01570	189 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	HTR1E	P28566	365 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	SLC7A1	P30825	629 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	EIF1AX	P47813	144 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	CARD18	P57730	90 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	PON3	Q15166	354 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	SGCB	Q16585	318 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	FBXL19-AS1	Q494R0	122 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	SYT14P1	Q58G82	188 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	HBM	Q6B0K9	141 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	GTF2IRD2B	Q6EKJ0	949 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	P4HA3	Q7Z4N8	544 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	GTF2IRD2	Q86UP8	949 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	LSMEM1	Q8N8F7	131 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF524	Q96C55	264 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	LRRC46	Q96FV0	321 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF583	Q96ND8	569 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	PIGM	Q9H3S5	423 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	RNF122	Q9H9V4	155 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	C12orf10	Q9HB07	376 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	GP6	Q9HCN6	339 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	TES	Q9UGI8	421 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	FOXD3	Q9UJU5	478 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	SLC13A4	Q9UKG4	626 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	HDGFL3	Q9Y3E1	203 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	KDM4E	B2RXH2	506 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	AP3D1	O14617	1153 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	TNFSF11	O14788	317 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	SYNGR4	O95473	234 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	IL11	P20809	199 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	SFTPD	P35247	375 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	PEX19	P40855	299 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	PCYT1A	P49585	367 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	NUDT2	P50583	147 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	MNAT1	P51948	309 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF136	P52737	540 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	RAC3	P60763	192 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	CSNK2A1	P68400	391 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM176B	Q3YBM2	270 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	ADGRG3	Q86Y34	549 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	CCDC71	Q8IV32	467 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	SLC43A2	Q8N370	569 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	NAXE	Q8NCW5	288 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	OR2T12	Q8NG77	320 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	OSTF1	Q92882	214 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	TRIM8	Q9BZR9	551 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	SLC24A3	Q9HC58	644 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	CTPS2	Q9NRF8	586 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	NDE1	Q9NXR1	346 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	OSGIN1	Q9UJX0	560 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	TRAPPC4	Q9Y296	219 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	PKDREJ	Q9NTG1	2253 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	TMED7-TICAM2	A0A0A6YYA0	188 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	PRSS44	E7EML9	344 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241		H0YC42	278 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241		M0QX08	132 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	CXCL13	O43927	109 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	FMO6P	O60774	539 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	PMS2P2	O95744	297 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	TGM6	O95932	706 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	GKN3P	P0CG01	181 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	KCNJ5	P48544	419 aa		13.12	□□□□□ -0.31

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