RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444658.7

CCNDBP1-202, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 1,479 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-202ENST00000444658 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa8.45□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 CDC14CA4D256 554 aa8.45□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 AGRPO00253 132 aa8.45□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 RGS10O43665 173 aa8.45□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 RAD1O60671 282 aa8.45□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 NOL3O60936 208 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 HMGN1P05114 100 aa8.45□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 SERPINA7P05543 415 aa8.45□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 PCMT1P22061 227 aa8.45□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 ACVR2AP27037 513 aa8.45□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 IDH2P48735 452 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 FOXL2P58012 376 aa8.45□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 DNASE1L3Q13609 305 aa8.45□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 OCLNQ16625 522 aa8.45□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 TMEM201Q5SNT2 666 aa8.45□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 SLC27A4Q6P1M0 643 aa8.45□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 CASP12Q6UXS9 341 aa8.45□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 WDR88Q6ZMY6 472 aa8.45□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 RTL4Q6ZR62 310 aa8.45□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa8.45□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa8.45□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa8.45□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa8.45□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 OR6S1Q8NH40 331 aa8.45□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 CNIH3Q8TBE1 160 aa8.45□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 GPR119Q8TDV5 335 aa8.45□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 GRHL3Q8TE85 626 aa8.45□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 RAB2BQ8WUD1 216 aa8.45□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 MYDGFQ969H8 173 aa8.45□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 C3orf49Q96BT1 292 aa8.45□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 ISOC1Q96CN7 298 aa8.45□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 BPIFA2Q96DR5 249 aa8.45□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 SGCZQ96LD1 299 aa8.45□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 RASL10BQ96S79 203 aa8.45□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa8.45□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 CTPS2Q9NRF8 586 aa8.45□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 FKBP14Q9NWM8 211 aa8.45□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 FOXJ2Q9P0K8 574 aa8.45□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 BAIAP2Q9UQB8 552 aa8.45□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 RNF6Q9Y252 685 aa8.45□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 CARD8Q9Y2G2 431 aa8.45□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 NTNG1Q9Y2I2 539 aa8.45□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa8.44□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 UNC119BA6NIH7 251 aa8.44□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 CLCA1A8K7I4 914 aa8.44□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 H3BN98 237 aa8.44□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 WWP2O00308 870 aa8.44□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 HCRTR2O43614 444 aa8.44□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 OR2J2O76002 312 aa8.44□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 MLF1P58340 268 aa8.44□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF117Q03924 483 aa8.44□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 GINS1Q14691 196 aa8.44□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 TMEM44Q2T9K0 475 aa8.44□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 SLC25A53Q5H9E4 307 aa8.44□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 C3orf38Q5JPI3 329 aa8.44□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 SLC30A6Q6NXT4 461 aa8.44□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 CBLN3Q6UW01 205 aa8.44□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 PTCHD4Q6ZW05 846 aa8.44□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 MARCH3Q86UD3 253 aa8.44□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 RAB43Q86YS6 212 aa8.44□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF540Q8NDQ6 660 aa8.44□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa8.44□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa8.44□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 DUSP19Q8WTR2 217 aa8.44□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 APH1BQ8WW43 257 aa8.44□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 TMEM234Q8WY98 164 aa8.44□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 ST8SIA1Q92185 356 aa8.44□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 FGF11Q92914 225 aa8.44□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 NKD1Q969G9 470 aa8.44□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 MESP1Q9BRJ9 268 aa8.44□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 SH2D2AQ9NP31 389 aa8.44□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 IMPAD1Q9NX62 359 aa8.44□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF226Q9NYT6 803 aa8.44□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 CNIH4Q9P003 139 aa8.44□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa8.44□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 CDH10Q9Y6N8 788 aa8.44□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 SPEGQ15772 3267 aa8.43□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 ANKUB1A6NFN9 424 aa8.43□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 SNTNA6NMZ2 147 aa8.43□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 ENO4A6NNW6 628 aa8.43□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 PTGES3LE9PB15 166 aa8.43□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 M0R3G1 203 aa8.43□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 SLC30A4O14863 429 aa8.43□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms