RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439365.6

NPAS1-201, Transcript of neuronal PAS domain protein 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene NPAS1, Length 1,341 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS1-201ENST00000439365 ACER3Q9NUN7 267 aa17.4■□□□□ 0.38
NPAS1-201ENST00000439365 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
NPAS1-201ENST00000439365 HMGN4O00479 90 aa17.39■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 C1QCP02747 245 aa17.39■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 IL12AP29459 219 aa17.39■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 DIO1P49895 249 aa17.39■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 SYPL1Q16563 259 aa17.39■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 SYT14P1Q58G82 188 aa17.39■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 SFRP5Q5T4F7 317 aa17.39■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 HDXQ7Z353 690 aa17.39■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 GABRG1Q8N1C3 465 aa17.39■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa17.39■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 OIT3Q8WWZ8 545 aa17.39■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 INPP5KQ9BT40 448 aa17.39■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 SAP130Q9H0E3 1048 aa17.39■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 MANSC1Q9H8J5 431 aa17.39■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 CTPS2Q9NRF8 586 aa17.39■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 ACANP16112 2415 aa17.38■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 CLDN24A6NM45 220 aa17.38■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 SLCO1B7G3V0H7 640 aa17.38■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 DNAJA2O60884 412 aa17.38■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 SNNO75324 88 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 PLAUP00749 431 aa17.38■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 FESP07332 822 aa17.38■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 GUSBP08236 651 aa17.38■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 CCNA2P20248 432 aa17.38■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 CDKN2CP42773 168 aa17.38■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 LRRC74AQ0VAA2 488 aa17.38■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 TTMPQ5BVD1 217 aa17.38■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 TMPPEQ6ZT21 453 aa17.38■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa17.38■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 ZNF100Q8IYN0 542 aa17.38■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 ANKFN1Q8N957 763 aa17.38■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa17.38■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa17.38■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 SMR3AQ99954 134 aa17.38■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 BCO1Q9HAY6 547 aa17.38■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 NGBQ9NPG2 151 aa17.38■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 CHRNA9Q9UGM1 479 aa17.38■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 LIPT1Q9Y234 373 aa17.38■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 GPR45Q9Y5Y3 372 aa17.38■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa17.37■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 RFXANKO14593 260 aa17.37■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 CLOCKO15516 846 aa17.37■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 CYTIPO60759 359 aa17.37■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 ANP32DO95626 131 aa17.37■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 INHBBP09529 407 aa17.37■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 NR2F1P10589 423 aa17.37■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 IDH2P48735 452 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 ITGADQ13349 1161 aa17.37■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 GNA13Q14344 377 aa17.37■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 P2RY6Q15077 328 aa17.37■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 STK11Q15831 433 aa17.37■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 Q71RC1 249 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 GRINAQ7Z429 371 aa17.37■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 BIVMQ86UB2 503 aa17.37■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 FAM71CQ8NEG0 241 aa17.37■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 TMEM171Q8WVE6 324 aa17.37■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 HSD17B8Q92506 261 aa17.37■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 Q96MF0 132 aa17.37■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 CCDC106Q9BWC9 280 aa17.37■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 PRSS50Q9UI38 385 aa17.37■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 ZNF814B7Z6K7 855 aa17.36■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 SLC22A3O75751 556 aa17.36■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 LYZL6O75951 148 aa17.36■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 KRT75O95678 551 aa17.36■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 IL6P05231 212 aa17.36■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 IDO1P14902 403 aa17.36■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 IL7RP16871 459 aa17.36■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 OR3A2P47893 321 aa17.36■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 TAB1Q15750 504 aa17.36■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 COX20Q5RI15 118 aa17.36■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 Q6ZT83 130 aa17.36■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 GALNT5Q7Z7M9 940 aa17.36■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa17.36■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP17.36■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 EMC3Q9P0I2 261 aa17.36■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 HS3ST1O14792 307 aa17.35■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 CHRM4P08173 479 aa17.35■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa17.35■□□□□ 0.37
NPAS1-201ENST00000439365 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms