RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428450.5

DDX39B-209, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 4

Gene DDX39B, Length 633 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-209ENST00000428450 OR4F21O95013 312 aa9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 OTCP00480 354 aa9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 FSHBP01225 129 aa9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 CRYAAP02489 173 aa9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 RPS17P08708 135 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 NUDT17P0C025 328 aa9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 SAGP10523 405 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 TSPAN8P19075 237 aa9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 COL8A2P25067 703 aa9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 CDH13P55290 713 aa9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 IL13RA1P78552 427 aa9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 NAAAQ02083 359 aa9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 TGFBR3Q03167 851 aa9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 HGFACQ04756 655 aa9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 ACSM2AQ08AH3 577 aa9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 DUSP5Q16690 384 aa9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 NDUFAF6Q330K2 333 aa9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 HIKESHIQ53FT3 197 aa9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 SPIN4Q56A73 249 aa9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 TSPO2Q5TGU0 170 aa9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 ACSM2BQ68CK6 577 aa9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 FAM71E1Q6IPT2 247 aa9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 C3orf33Q6P1S2 294 aa9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 ANKRD16Q6P6B7 361 aa9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 CCDC91Q7Z6B0 441 aa9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 NUP37Q8NFH4 326 aa9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 CEP70Q8NHQ1 597 aa9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 FBXO30Q8TB52 745 aa9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP9.92□□□□□ -0.827e-10■■□□□ 12.7
DDX39B-209ENST00000428450 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 ZNF442Q9H7R0 627 aa9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 NFU1Q9UMS0 254 aa9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 JRKLQ9Y4A0 524 aa9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 ADRA2AP08913 450 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 NPR2P20594 1047 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 MPGP29372 298 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 GCH1P30793 250 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 NTSP30990 170 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 THBS4P35443 961 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 GSTM5P46439 218 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 QPRTQ15274 297 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 TIGD2Q4W5G0 525 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 LRIG3Q6UXM1 1119 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 SPATA21Q7Z572 469 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 CCDC103Q8IW40 242 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 CDK20Q8IZL9 346 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 SYT14Q8NB59 555 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 NANPQ8TBE9 248 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 C16orf58Q96GQ5 468 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 DUX5Q96PT3 197 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 OSBPL9Q96SU4 736 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 KCNS3Q9BQ31 491 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 TPK1Q9H3S4 243 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 SEC61A2Q9H9S3 476 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 SLC52A3Q9NQ40 469 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 SIRT5Q9NXA8 310 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 UPB1Q9UBR1 384 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 A0A096LPK6 155 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 PRSS23O95084 383 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 CECR9P0C854 216 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 SERPINB4P48594 390 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 PRKAG1P54619 331 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 MYBPC1Q00872 1141 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 ZNF763Q0D2J5 394 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 SYT14P1Q58G82 188 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 MROH9Q5TGP6 573 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 KLC3Q6P597 504 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 KLHL24Q6TFL4 600 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 CASP12Q6UXS9 341 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 OR4F15Q8NGB8 312 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 OR5W2Q8NH69 310 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 PIGXQ8TBF5 258 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 CKAP2Q8WWK9 683 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 TRIM31Q9BZY9 425 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 DYNLRB1Q9NP97 96 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 OBP2BQ9NPH6 170 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 MIEF1Q9NQG6 463 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 OPN4Q9UHM6 478 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 CORINQ9Y5Q5 1042 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-209ENST00000428450 A0A0G2JMP0 313 aa9.89□□□□□ -0.83
DDX39B-209ENST00000428450 A0A0X1KG70 313 aa9.89□□□□□ -0.83
DDX39B-209ENST00000428450 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa9.89□□□□□ -0.83
DDX39B-209ENST00000428450 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
DDX39B-209ENST00000428450 PLPP2O43688 288 aa9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.7 ms