RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 MAVSQ7Z434 540 aa13.57□□□□□ -0.24
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PTPRU-204ENST00000428026 ZNF619Q8N2I2 560 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRU-204ENST00000428026 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRU-204ENST00000428026 OR5M11Q96RB7 305 aa13.57□□□□□ -0.24
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PTPRU-204ENST00000428026 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
PTPRU-204ENST00000428026 EDIL3O43854 480 aa13.56□□□□□ -0.24
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PTPRU-204ENST00000428026 GPR26Q8NDV2 337 aa13.56□□□□□ -0.24
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PTPRU-204ENST00000428026 LRIG1Q96JA1 1093 aa13.56□□□□□ -0.24
PTPRU-204ENST00000428026 ZNF681Q96N22 645 aa13.56□□□□□ -0.24
PTPRU-204ENST00000428026 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa13.56□□□□□ -0.24
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PTPRU-204ENST00000428026 SLC22A6Q4U2R8 563 aa13.56□□□□□ -0.24
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PTPRU-204ENST00000428026 OR56B4Q8NH76 319 aa13.56□□□□□ -0.24
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PTPRU-204ENST00000428026 CXCL16Q9H2A7 254 aa13.56□□□□□ -0.24
PTPRU-204ENST00000428026 RETREG1Q9H6L5 497 aa13.56□□□□□ -0.24
PTPRU-204ENST00000428026 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
PTPRU-204ENST00000428026 GFOD1Q9NXC2 390 aa13.56□□□□□ -0.24
PTPRU-204ENST00000428026 FAM221BA6H8Z2 402 aa13.55□□□□□ -0.24
PTPRU-204ENST00000428026 ACOD1A6NK06 481 aa13.55□□□□□ -0.24
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PTPRU-204ENST00000428026 TLE3Q04726 772 aa13.55□□□□□ -0.24
PTPRU-204ENST00000428026 SLC14A1Q13336 389 aa13.55□□□□□ -0.24
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PTPRU-204ENST00000428026 HORMAD2Q8N7B1 307 aa13.55□□□□□ -0.24
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PTPRU-204ENST00000428026 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa13.55□□□□□ -0.24
PTPRU-204ENST00000428026 KCNIP1Q9NZI2 227 aa13.55□□□□□ -0.24
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PTPRU-204ENST00000428026 HBA1P69905 142 aa13.55□□□□□ -0.24
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PTPRU-204ENST00000428026 USP53Q70EK8 1073 aa13.55□□□□□ -0.24
PTPRU-204ENST00000428026 OR51Q1Q8NH59 317 aa13.55□□□□□ -0.24
PTPRU-204ENST00000428026 HHIPQ96QV1 700 aa13.55□□□□□ -0.24
PTPRU-204ENST00000428026 NTMT1Q9BV86 223 aa13.55□□□□□ -0.24
PTPRU-204ENST00000428026 GNG13Q9P2W3 67 aa13.55□□□□□ -0.24
PTPRU-204ENST00000428026 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
PTPRU-204ENST00000428026 FAM227AF5H4B4 570 aa13.55□□□□□ -0.24
PTPRU-204ENST00000428026 SOCS6O14544 535 aa13.55□□□□□ -0.24
PTPRU-204ENST00000428026 DNAJB6O75190 326 aa13.55□□□□□ -0.24
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