RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FBXW9Q5XUX1 488 aa11.6□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC22A25Q6T423 547 aa11.6□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMPPEQ6ZT21 453 aa11.6□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HOMEZQ8IX15 550 aa11.6□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FBXL14Q8N1E6 418 aa11.6□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MUC15Q8N387 334 aa11.6□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NATD1Q8N6N6 113 aa11.6□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF525Q8N782 197 aa11.6□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ELOA3Q8NG57 546 aa11.6□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR5D16Q8NGK9 328 aa11.6□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR52N5Q8NH56 324 aa11.6□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR5AK3PQ8NH89 298 aa11.6□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ST8SIA1Q92185 356 aa11.6□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MOAP1Q96BY2 351 aa11.6□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCNK17Q96T54 332 aa11.6□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NMUR2Q9GZQ4 415 aa11.6□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATAD3AQ9NVI7 634 aa11.6□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ALPK2Q86TB3 2170 aa11.59□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa11.59□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 H7C417 338 aa11.59□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SULT2B1O00204 365 aa11.59□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DNAJA2O60884 412 aa11.59□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CYP7B1O75881 506 aa11.59□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHRNGP07510 517 aa11.59□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CD40P25942 277 aa11.59□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF83P51522 516 aa11.59□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RAB35Q15286 201 aa11.59□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KLHL17Q6TDP4 642 aa11.59□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 B3GLCTQ6Y288 498 aa11.59□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UBE2J2Q8N2K1 259 aa11.59□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HTRA1Q92743 480 aa11.59□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PPP3R2Q96LZ3 170 aa11.59□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SDF2Q99470 211 aa11.59□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BEX2Q9BXY8 128 aa11.59□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LAT2Q9GZY6 243 aa11.59□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MANSC1Q9H8J5 431 aa11.59□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SERINC1Q9NRX5 453 aa11.59□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LPAR3Q9UBY5 353 aa11.59□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC25A15Q9Y619 301 aa11.59□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa11.58□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A1W2PR80 420 aa11.58□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CIB4A0PJX0 185 aa11.58□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF716A6NP11 495 aa11.58□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRIM13O60858 407 aa11.58□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SHBGP04278 402 aa11.58□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FGF4P08620 206 aa11.58□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRT4P19013 534 aa11.58□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SOAT1P35610 550 aa11.58□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FABP6P51161 128 aa11.58□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SESN3P58005 492 aa11.58□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHRNEQ04844 493 aa11.58□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MERTKQ12866 999 aa11.58□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PDK3Q15120 406 aa11.58□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPR68Q15743 365 aa11.58□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF141Q15928 474 aa11.58□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UGT3A2Q3SY77 523 aa11.58□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 XKR7Q5GH72 579 aa11.58□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF544Q6NX49 715 aa11.58□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C4orf33Q8N1A6 199 aa11.58□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM234Q8WY98 164 aa11.58□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM168AQ92567 244 aa11.58□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 APH1AQ96BI3 265 aa11.58□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C1orf50Q9BV19 199 aa11.58□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SERHL2Q9H4I8 314 aa11.58□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TAS2R16Q9NYV7 291 aa11.58□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MALT1Q9UDY8 824 aa11.58□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCNE5Q9UJ90 142 aa11.58□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRAF6Q9Y4K3 522 aa11.58□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCT8L1PA6NM43 557 aa11.57□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 M0R1B8 84 aa11.57□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CFLARO15519 480 aa11.57□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PEX11AO75192 247 aa11.57□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AK1P00568 194 aa11.57□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CSTAP01040 98 aa11.57□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CSF3P09919 207 aa11.57□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PGCP20142 388 aa11.57□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPS26P62854 115 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa11.57□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa11.57□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CYB5R2Q6BCY4 276 aa11.57□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BHLHB9Q6PI77 547 aa11.57□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DEPDC4Q8N2C3 294 aa11.57□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa11.57□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PIGXQ8TBF5 258 aa11.57□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C10orf105Q8TEF2 133 aa11.57□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COQ8BQ96D53 544 aa11.57□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa11.57□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 INPP5KQ9BT40 448 aa11.57□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa11.57□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.1 ms