RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 KAT7O95251 611 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 TXNDC12O95881 172 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 PTHLHP12272 177 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 CCR6P51684 374 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ATP12AP54707 1039 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 LCN1P1Q5VSP4 162 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 HACD4Q5VWC8 232 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 CNKSR3Q6P9H4 555 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 VITQ6UXI7 678 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 LRRTM1Q86UE6 522 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 SFTPA2Q8IWL1 248 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 OR56A1Q8NGH5 318 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 OR51G2Q8NGK0 314 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 OR9A2Q8NGT5 310 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 OR10AC1Q8NH08 325 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 STK35Q8TDR2 534 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 UFD1Q92890 307 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 SAMD8Q96LT4 415 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 OR1F2PQ96R84 312 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF607Q96SK3 696 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ALG8Q9BVK2 526 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 C1orf198Q9H425 327 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 INPP5EQ9NRR6 644 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM8A1Q9UBU6 413 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 OR14I1A6ND48 311 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 TBC1D3BA6NDS4 549 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 CLUP10909 449 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 HLA-GP17693 338 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 DRD5P21918 477 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 GPR4P46093 362 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 BAMBIQ13145 260 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 IL15RAQ13261 267 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF234Q14588 700 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 CDC73Q6P1J9 531 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 MED25Q71SY5 747 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 NR4A3Q92570 626 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 MCHR1Q99705 422 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 RTN4RQ9BZR6 473 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ATG2BQ96BY7 2078 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 CHST10O43529 356 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 PPM1BO75688 479 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF735P0CB33 412 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 CSF2RAP15509 400 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ANOS1P23352 680 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 RPE65Q16518 533 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 NTRK2Q16620 822 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 BCL2L15Q5TBC7 163 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 DCAF12L2Q5VW00 463 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 GLB1L2Q8IW92 636 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 MS4A15Q8N5U1 240 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 SAMD12Q8N8I0 201 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 CXorf40AQ8TE69 158 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 VSTM2LQ96N03 204 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF285Q96NJ3 590 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 MAT2BQ9NZL9 334 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 NUP50Q9UKX7 468 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 KIF26BQ2KJY2 2108 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A1B0GUH1 482 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 CD8B2A6NJW9 211 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 IFITM5A6NNB3 132 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 TTLL8A6PVC2 850 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 EMC8O43402 210 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 CH25HO95992 272 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 IGF2P01344 180 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 CD8BP10966 210 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 VIPR2P41587 438 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 DIO1P49895 249 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 RUNX1T1Q06455 604 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 MAB21L1Q13394 359 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF284Q2VY69 593 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 TRIM60Q495X7 471 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 SPDYE7PQ495Y7 208 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 FDX2Q6P4F2 183 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 NLRC3Q7RTR2 1065 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 FGD2Q7Z6J4 655 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 C11orf74Q86VG3 221 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 CMTM4Q8IZR5 234 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 OR14A16Q8NHC5 309 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 NUS1Q96E22 293 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 SIPA1Q96FS4 1042 aa3.33□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45 ms