RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415172.1

VPS13A-AS1-201, VPS13A antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS13A-AS1, Length 519 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DLX5P56178 289 aa15.6■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EPS8Q12929 822 aa15.6■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PTOV1Q86YD1 416 aa15.6■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC30A8Q8IWU4 369 aa15.6■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GCNT2Q8N0V5 402 aa15.6■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FNDC9Q8TBE3 224 aa15.6■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FIG4Q92562 907 aa15.6■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RCN3Q96D15 328 aa15.6■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SFXN3Q9BWM7 321 aa15.6■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PRRG4Q9BZD6 226 aa15.6■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CREBBPQ92793 2442 aa15.6■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PRORSD1PA6NEY8 169 aa15.59■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CXCL13O43927 109 aa15.59■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IL18BPO95998 194 aa15.59■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SHC1P29353 583 aa15.59■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CARD18P57730 90 aa15.59■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 COPZ1P61923 177 aa15.59■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RABL3Q5HYI8 236 aa15.59■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa15.59■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CLIP4Q8N3C7 705 aa15.59■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC35B4Q969S0 331 aa15.59■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CMTM5Q96DZ9 223 aa15.59■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ECSITQ9BQ95 431 aa15.59■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MYLK2Q9H1R3 596 aa15.59■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RNF122Q9H9V4 155 aa15.59■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CHRNA9Q9UGM1 479 aa15.59■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PRDM4Q9UKN5 801 aa15.59■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CRHP06850 196 aa15.58■□□□□ 0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GKN3PP0CG01 181 aa15.58■□□□□ 0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PCGF2P35227 344 aa15.58■□□□□ 0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC1A3P43003 542 aa15.58■□□□□ 0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SYT14P1Q58G82 188 aa15.58■□□□□ 0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa15.58■□□□□ 0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ARPINQ7Z6K5 226 aa15.58■□□□□ 0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TREML1Q86YW5 311 aa15.58■□□□□ 0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ARMC8Q8IUR7 673 aa15.58■□□□□ 0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZZZ3Q8IYH5 903 aa15.58■□□□□ 0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OSTF1Q92882 214 aa15.58■□□□□ 0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LRRC46Q96FV0 321 aa15.58■□□□□ 0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OR5B2Q96R09 309 aa15.58■□□□□ 0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CTPS2Q9NRF8 586 aa15.58■□□□□ 0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC13A4Q9UKG4 626 aa15.58■□□□□ 0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa15.58■□□□□ 0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CHST2Q9Y4C5 530 aa15.58■□□□□ 0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FREM3P0C091 2139 aa15.58■□□□□ 0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa15.57■□□□□ 0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C19orf84I3L1E1 186 aa15.57■□□□□ 0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 AIM2O14862 343 aa15.57■□□□□ 0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 AQP8O94778 261 aa15.57■□□□□ 0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PLGP00747 810 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TACR3P29371 465 aa15.57■□□□□ 0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ASCL1P50553 236 aa15.57■□□□□ 0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TFF3Q07654 80 aa15.57■□□□□ 0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FOXF2Q12947 444 aa15.57■□□□□ 0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 VMACQ2NL98 169 aa15.57■□□□□ 0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PIGWQ7Z7B1 504 aa15.57■□□□□ 0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CADM2Q8N3J6 435 aa15.57■□□□□ 0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PIF1Q9H611 641 aa15.57■□□□□ 0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 COQ10BQ9H8M1 238 aa15.57■□□□□ 0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EFCAB1Q9HAE3 211 aa15.57■□□□□ 0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KLHL28Q9NXS3 571 aa15.57■□□□□ 0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ABCA12Q86UK0 2595 aa15.57■□□□□ 0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MED12Q93074 2177 aa15.56■□□□□ 0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa15.56■□□□□ 0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 A0A1W2PNR3 127 aa15.56■□□□□ 0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 A0A1W2PNV4 684 aa15.56■□□□□ 0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TFPIP10646 304 aa15.56■□□□□ 0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PRG2P13727 222 aa15.56■□□□□ 0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 COX6B1P14854 86 aa15.56■□□□□ 0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PRDX6P30041 224 aa15.56■□□□□ 0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MAP2K6P52564 334 aa15.56■□□□□ 0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF787Q6DD87 383 aa15.56■□□□□ 0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 WBP2NLQ6ICG8 309 aa15.56■□□□□ 0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ERICH5Q6P6B1 374 aa15.56■□□□□ 0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa15.56■□□□□ 0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SRXN1Q9BYN0 137 aa15.56■□□□□ 0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PIGMQ9H3S5 423 aa15.56■□□□□ 0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OSGIN1Q9UJX0 560 aa15.56■□□□□ 0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PACSIN3Q9UKS6 424 aa15.56■□□□□ 0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 AP3M1Q9Y2T2 418 aa15.56■□□□□ 0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TMED7Q9Y3B3 224 aa15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.1 ms