RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 FLRT3Q9NZU0 649 aa21.92■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 KLHL21Q9UJP4 597 aa21.92■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 POMT2Q9UKY4 750 aa21.92■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 MYO15AQ9UKN7 3530 aa21.91■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa21.91■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 NPIPA7E9PJI5 369 aa21.91■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 OR10H2O60403 315 aa21.91■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 IGLV3-19P01714 112 aa21.91■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 NPIPA8P0DM63 369 aa21.91■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 TMEM31Q5JXX7 168 aa21.91■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 ULK3Q6PHR2 472 aa21.91■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 LIX1LQ8IVB5 337 aa21.91■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 TMEM105Q8N8V8 129 aa21.91■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 OR13H1Q8NG92 308 aa21.91■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 OR10H4Q8NGA5 316 aa21.91■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 SLC37A2Q8TED4 501 aa21.91■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 FOLH1BQ9HBA9 442 aa21.91■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 GPR27Q9NS67 375 aa21.91■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa21.9■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 SMIM30A4D0T7 59 aa21.9■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 NPIPB9F8W1W9 429 aa21.9■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 TFECO14948 347 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 LYRM1O43325 122 aa21.9■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 FUT1P19526 365 aa21.9■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 NUDT1P36639 197 aa21.9■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 FGFBP1Q14512 234 aa21.9■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 P2RY14Q15391 338 aa21.9■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 KLHL12Q53G59 568 aa21.9■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 HMGB4Q8WW32 186 aa21.9■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 MARVELD1Q9BSK0 173 aa21.9■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa21.9■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa21.9■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 SLC43A1O75387 559 aa21.9■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 SERPINA3P01011 423 aa21.9■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 EMDP50402 254 aa21.9■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 CLDN20P56880 219 aa21.9■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 NRG3P56975 720 aa21.9■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 FHL1Q13642 323 aa21.9■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 GGTLC2Q14390 218 aa21.9■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 ISXQ2M1V0 245 aa21.9■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 ARMC6Q6NXE6 501 aa21.9■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 TCTE3Q8IZS6 198 aa21.9■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 SYS1Q8N2H4 156 aa21.9■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 POMGNT2Q8NAT1 580 aa21.9■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 G6PC3Q9BUM1 346 aa21.9■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
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PMS1-205ENST00000409985 RFPL3O75679 317 aa21.89■■□□□ 1.09
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PMS1-205ENST00000409985 GPR143P51810 404 aa21.89■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 RPS7P62081 194 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
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PMS1-205ENST00000409985 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 PRTGQ2VWP7 1150 aa21.89■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 ZAR1Q86SH2 424 aa21.89■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 ZNF595Q8IYB9 648 aa21.89■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa21.89■■□□□ 1.09
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PMS1-205ENST00000409985 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa21.88■■□□□ 1.09
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PMS1-205ENST00000409985 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
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PMS1-205ENST00000409985 INSL4Q14641 139 aa21.88■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 CDK10Q15131 360 aa21.88■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 ALG10BQ5I7T1 473 aa21.88■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa21.88■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 OR51V1Q9H2C8 321 aa21.88■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 FAM25AB3EWG3 89 aa21.88■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 FAM25CB3EWG5 89 aa21.88■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 FAM25GB3EWG6 89 aa21.88■■□□□ 1.09
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