RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CRHP06850 196 aa13.75□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC7A1P30825 629 aa13.75□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KCNJ5P48544 419 aa13.75□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PSME3P61289 254 aa13.75□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LIPEQ05469 1076 aa13.75□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DMTNQ08495 405 aa13.75□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SGCBQ16585 318 aa13.75□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HBMQ6B0K9 141 aa13.75□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MICU2Q8IYU8 434 aa13.75□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LSMEM1Q8N8F7 131 aa13.75□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR10D3Q8NH80 312 aa13.75□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC26A7Q8TE54 656 aa13.75□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa13.75□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SDCCAG3Q96C92 435 aa13.75□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ADAM19Q9H013 955 aa13.75□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PIF1Q9H611 641 aa13.75□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C12orf10Q9HB07 376 aa13.75□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RNF6Q9Y252 685 aa13.75□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A0G2JNJ9 132 aa13.74□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A0J9YW62 118 aa13.74□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CCT8L1PA6NM43 557 aa13.74□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NME4O00746 187 aa13.74□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EFNA2O43921 213 aa13.74□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FMO6PO60774 539 aa13.74□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TOXO94900 526 aa13.74□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LGI1O95970 557 aa13.74□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GKN3PP0CG01 181 aa13.74□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RNF224P0DH78 156 aa13.74□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IL11P20809 199 aa13.74□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TACR3P29371 465 aa13.74□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SFTPDP35247 375 aa13.74□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CARD18P57730 90 aa13.74□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NCALDP61601 193 aa13.74□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa13.74□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPATS1Q496A3 300 aa13.74□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SYT14P1Q58G82 188 aa13.74□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C16orf89Q6UX73 402 aa13.74□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 P4HA3Q7Z4N8 544 aa13.74□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PGAM4Q8N0Y7 254 aa13.74□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LILRB4Q8NHJ6 448 aa13.74□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TAMM41Q96BW9 452 aa13.74□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SFXN3Q9BWM7 321 aa13.74□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRIM2Q9C040 744 aa13.74□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM185BQ9H7F4 350 aa13.74□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CTPS2Q9NRF8 586 aa13.74□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ARL8BQ9NVJ2 186 aa13.74□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM181Q9P2C4 612 aa13.74□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 Q9UFV3 132 aa13.74□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OSGIN1Q9UJX0 560 aa13.74□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BAG5Q9UL15 447 aa13.74□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa13.74□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 POLEQ07864 2286 aa13.74□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa13.73□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 H0YC42 278 aa13.73□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DVL2O14641 736 aa13.73□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TNFSF11O14788 317 aa13.73□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DNPH1O43598 174 aa13.73□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TPST1O60507 370 aa13.73□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SYNGR4O95473 234 aa13.73□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRG2P13727 222 aa13.73□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CALB2P22676 271 aa13.73□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CTSSP25774 331 aa13.73□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KDELR2P33947 212 aa13.73□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OPRM1P35372 400 aa13.73□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CPA2P48052 419 aa13.73□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF136P52737 540 aa13.73□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RAC3P60763 192 aa13.73□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PON3Q15166 354 aa13.73□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DUSP7Q16829 419 aa13.73□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DMRTA1Q5VZB9 504 aa13.73□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa13.73□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa13.73□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ADGRG3Q86Y34 549 aa13.73□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CADM2Q8N3J6 435 aa13.73□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C9orf106Q8NAJ2 232 aa13.73□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SMYD1Q8NB12 490 aa13.73□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OSTF1Q92882 214 aa13.73□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DDIT4LQ96D03 193 aa13.73□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NSL1Q96IY1 281 aa13.73□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ARHGDIGQ99819 225 aa13.73□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF559Q9BR84 538 aa13.73□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RNF122Q9H9V4 155 aa13.73□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GLRX2Q9NS18 164 aa13.73□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMED7Q9Y3B3 224 aa13.73□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CROCCQ5TZA2 2017 aa13.73□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CXCL13O43927 109 aa13.72□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FESP07332 822 aa13.72□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms