RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384545.1

RNU6-441P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 441, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-441P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-441P-201ENST00000384545 ANKRD19PQ9H560 264 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 NARFLQ9H6Q4 476 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 TMEM185BQ9H7F4 350 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 NMRAL1Q9HBL8 299 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 NT5MQ9NPB1 228 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 SCRT2Q9NQ03 307 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 SENP1Q9P0U3 644 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 PDE10AQ9Y233 779 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 PEX16Q9Y5Y5 336 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 SMCO3A2RU48 225 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 OR2AG2A6NM03 316 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 EFCAB7A8K855 629 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 A8MXQ7 604 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 B4DXG7 233 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 TRDCB7Z8K6 153 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 SULT2B1O00204 365 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 SLC17A2O00624 439 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 PRKYO43930 277 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 SCRG1O75711 98 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 NOL4O94818 638 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 GNA14O95837 355 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 KRT6AP02538 564 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 FTH1P02794 183 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 STAG3L3P0CL85 134 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 COX5AP20674 150 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 FDFT1P37268 417 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 ETV5P41161 510 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 ELK3P41970 407 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 XCR1P46094 333 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 QARSP47897 775 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 PRKXP51817 358 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 EFNA3P52797 238 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 CDH6P55285 790 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 PLP1P60201 277 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 ERVK11-1P61568 191 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 RPS15P62841 145 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 LTB4RQ15722 352 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 MICBQ29980 383 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 CAVIN4Q5BKX8 364 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 ENPP6Q6UWR7 440 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 OTUD6AQ7L8S5 288 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 SLC47A2Q86VL8 602 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 ABHD12Q8N2K0 398 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 OR2L13Q8N349 312 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 C9orf106Q8NAJ2 232 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 CATSPER1Q8NEC5 780 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 SDR9C7Q8NEX9 313 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 OR4C5Q8NGB2 326 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 FAM110BQ8TC76 370 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 TM4SF19Q96DZ7 209 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 PPP1R16AQ96I34 528 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 C12orf42Q96LP6 360 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 LINC00479Q96M42 142 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 CCT8L2Q96SF2 557 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 BPIFA3Q9BQP9 254 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 LRRC61Q9BV99 259 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 ZBP1Q9H171 429 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 CAB39LQ9H9S4 337 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 CUTCQ9NTM9 273 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 COPS3Q9UNS2 423 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 FRG2CA6NGY1 282 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 CCT8L1PA6NM43 557 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 EPM2AB3EWF7 344 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 IDSB3KWA1 339 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 SLC2A10O95528 541 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 LGALS2P05162 132 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 MELTFP08582 738 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 ANXA13P27216 316 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 EPHX2P34913 555 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 HMGCS2P54868 508 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 SLC8A3P57103 927 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 MERTKQ12866 999 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 VGLL4Q14135 290 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-441P-201ENST00000384545 HADHQ16836 314 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms