RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380221.7

TRAPPC10-202, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC10, Length 1,763 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-202ENST00000380221 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 DSN1Q9H410 356 aa25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 A0A0B4J2E0 115 aa25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 A0A0G2JMM0 328 aa25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 A0A1B0GX12 115 aa25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 A0A1W2PPB8 328 aa25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 A0A1W2PRS3 328 aa25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 KIR3DP1A8MWS1 328 aa25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 GNB5O14775 395 aa25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLC25A12O75746 678 aa25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 DNASE1L1P49184 302 aa25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 GPR119Q8TDV5 335 aa25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 MYRFQ9Y2G1 1151 aa25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 CACNA1AO00555 2505 aa25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 TAF4O00268 1085 aa25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 LYPD3O95274 346 aa25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 PGCP20142 388 aa25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 MST1P26927 711 aa25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 GPR85P60893 370 aa25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 IL18R1Q13478 541 aa25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 TRAM2Q15035 370 aa25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF691Q5VV52 312 aa25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 THAP5Q7Z6K1 395 aa25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF786Q8N393 782 aa25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 HAS2Q92819 552 aa25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 HES7Q9BYE0 225 aa25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 DEPPQ9NTK1 212 aa25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 FBXL2Q9UKC9 423 aa25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 EPHA2P29317 976 aa25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 ARG2P78540 354 aa25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 KEAP1Q14145 624 aa25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 ALG10BQ5I7T1 473 aa25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 WBP2NLQ6ICG8 309 aa25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR2M3Q8NG83 312 aa25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 PRSS27Q9BQR3 290 aa25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 RNF32Q9H0A6 362 aa25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 BATF3Q9NR55 127 aa25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 MGAT4BQ9UQ53 548 aa25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 NCOR2Q9Y618 2525 aa25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 ANKUB1A6NFN9 424 aa25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 CDK2AP1O14519 115 aa25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 SNX4O95219 450 aa25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 ADAP00813 363 aa25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 MSX1P28360 303 aa25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 MASP1P48740 699 aa25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 PGBD2Q6P3X8 592 aa25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 WDR88Q6ZMY6 472 aa25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 LINC00471Q8N535 108 aa25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLC38A4Q969I6 547 aa25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 GMPPBQ9Y5P6 360 aa25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 PTNP21246 168 aa25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 QPRTQ15274 297 aa25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 ULK3Q6PHR2 472 aa25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 ARSKQ6UWY0 536 aa25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 PLCZ1Q86YW0 608 aa25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 FADS6Q8N9I5 356 aa25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 MDS2Q8NDY4 140 aa25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR4K5Q8NGD3 323 aa25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMEM255BQ8WV15 326 aa25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 C3orf49Q96BT1 292 aa25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMEM41AQ96HV5 264 aa25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 ANKRD19PQ9H560 264 aa25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 SNPHO15079 494 aa25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 CHP2O43745 196 aa25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 CNR1P21554 472 aa25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 UGT2B15P54855 530 aa25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMPRSS3P57727 454 aa25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 KLHL17Q6TDP4 642 aa25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 IGFL2Q6UWQ7 119 aa25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 PARP8Q8N3A8 854 aa25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR4K17Q8NGC6 315 aa25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR1J4Q8NGS1 313 aa25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 GNRHR2Q96P88 292 aa25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP25.19■■□□□ 1.622e-9■■■□□ 17.5
TRAPPC10-202ENST00000380221 KLHL1Q9NR64 748 aa25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 TAS2R10Q9NYW0 307 aa25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 VDAC3Q9Y277 283 aa25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 A0A087WUU8 490 aa25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 E9PQ18 207 aa25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 WISP1O95388 367 aa25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLC1A3P43003 542 aa25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 RPS6KA3P51812 740 aa25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 PITX2Q99697 317 aa25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 SELENONQ9NZV5 590 aa25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 CSAG2Q9Y5P2 127 aa25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 ISL1P61371 349 aa25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 TIGD3Q6B0B8 471 aa25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC10-202ENST00000380221 SETD9Q8NE22 299 aa25.18■■□□□ 1.62
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