RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370002.7

PITX3-201, Transcript of paired like homeodomain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX3, Length 1,391 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3-201ENST00000370002 CLEC4AQ9UMR7 237 aa18.12■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 USH1CQ9Y6N9 552 aa18.12■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 AGAP5A6NIR3 686 aa18.11■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 FAAHO00519 579 aa18.11■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 EBAG9O00559 213 aa18.11■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 RFXANKO14593 260 aa18.11■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 UBDO15205 165 aa18.11■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 DNPH1O43598 174 aa18.11■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 H6PDO95479 791 aa18.11■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 RIPPLY3P57055 190 aa18.11■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 GPAT3Q53EU6 434 aa18.11■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 GRINAQ7Z429 371 aa18.11■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa18.11■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 ROBO4Q8WZ75 1007 aa18.11■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 TMUB1Q9BVT8 246 aa18.11■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 KLHL4Q9C0H6 718 aa18.11■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 CALML5Q9NZT1 146 aa18.11■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 DCTN4Q9UJW0 460 aa18.11■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 A0A0G2JND7 137 aa18.1■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa18.1■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa18.1■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 CYP7B1O75881 506 aa18.1■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 CASP9P55211 416 aa18.1■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 NME5P56597 212 aa18.1■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 CHRNEQ04844 493 aa18.1■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 P2RY6Q15077 328 aa18.1■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 PDK3Q15120 406 aa18.1■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 ZSWIM7Q19AV6 140 aa18.1■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa18.1■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 TMPPEQ6ZT21 453 aa18.1■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa18.1■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 SSX8Q7RTT4 187 aa18.1■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 STEAP2Q8NFT2 490 aa18.1■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 ABHD3Q8WU67 409 aa18.1■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 C10orf82Q8WW14 230 aa18.1■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 PIGTQ969N2 578 aa18.1■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 ZNF524Q96C55 264 aa18.1■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 ZG16BQ96DA0 208 aa18.1■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 CCDC106Q9BWC9 280 aa18.1■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 SLC38A1Q9H2H9 487 aa18.1■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 A0A1W2PPR1 153 aa18.09■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 ZNF724A8MTY0 619 aa18.09■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 CD53P19397 219 aa18.09■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 FPR1P21462 350 aa18.09■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 ENPP1P22413 925 aa18.09■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 NR1H2P55055 460 aa18.09■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 AQP5P55064 265 aa18.09■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 MERTKQ12866 999 aa18.09■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP18.09■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa18.09■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 SYT14P1Q58G82 188 aa18.09■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 BEX5Q5H9J7 111 aa18.09■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 EPGNQ6UW88 154 aa18.09■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 TUSC5Q8IXB3 177 aa18.09■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 ZNF563Q8TA94 476 aa18.09■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 STON2Q8WXE9 905 aa18.09■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 ITCHQ96J02 903 aa18.09■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 INPP5KQ9BT40 448 aa18.09■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa18.09■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 TMEM45AQ9NWC5 275 aa18.09■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 CHRNA9Q9UGM1 479 aa18.09■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa18.09■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 SIAH2O43255 324 aa18.08■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 CYTIPO60759 359 aa18.08■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 DCTN3O75935 186 aa18.08■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 DBIP07108 87 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 CD99P14209 185 aa18.08■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 UQCRBP14927 111 aa18.08■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 FOSL1P15407 271 aa18.08■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 CDKN2CP42773 168 aa18.08■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 POU4F3Q15319 338 aa18.08■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 TFAP2EQ6VUC0 442 aa18.08■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 MAVSQ7Z434 540 aa18.08■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 ZNF440Q8IYI8 595 aa18.08■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 GABRG1Q8N1C3 465 aa18.08■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 MIER2Q8N344 545 aa18.08■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 OR5B2Q96R09 309 aa18.08■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 PSD2Q9BQI7 771 aa18.08■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 TRAPPC4Q9Y296 219 aa18.08■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 PCNX3Q9H6A9 2034 aa18.08■□□□□ 0.49
PITX3-201ENST00000370002 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
PITX3-201ENST00000370002 TMCC2O75069 709 aa18.07■□□□□ 0.48
PITX3-201ENST00000370002 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
PITX3-201ENST00000370002 PMS2P2O95744 297 aa18.07■□□□□ 0.48
PITX3-201ENST00000370002 NR2F1P10589 423 aa18.07■□□□□ 0.48
PITX3-201ENST00000370002 IL7RP16871 459 aa18.07■□□□□ 0.48
PITX3-201ENST00000370002 DIO1P49895 249 aa18.07■□□□□ 0.48
PITX3-201ENST00000370002 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
PITX3-201ENST00000370002 MVDP53602 400 aa18.07■□□□□ 0.48
PITX3-201ENST00000370002 SYPL1Q16563 259 aa18.07■□□□□ 0.48
PITX3-201ENST00000370002 ZSCAN26Q16670 478 aa18.07■□□□□ 0.48
PITX3-201ENST00000370002 C20orf204Q6ZNR8 217 aa18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms