RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 EVPLLA8MZ36 301 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 HMGN4O00479 90 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 EFNA2O43921 213 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 CYP7B1O75881 506 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 H6PDO95479 791 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 NTN1O95631 604 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 C1QCP02747 245 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 HRGP04196 525 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 GSNP06396 782 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 POU2F1P14859 743 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 CD1EP15812 388 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 AGTR1P30556 359 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 SLC7A1P30825 629 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 UGT2B10P36537 528 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 CDKN2CP42773 168 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 PCYT1AP49585 367 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 IST1P53990 364 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 CARD18P57730 90 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 GNGT1P63211 74 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 FAM27E3Q08E93 113 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 POU4F3Q15319 338 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 MAPK14Q16539 360 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 GPAT3Q53EU6 434 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 SLC25A53Q5H9E4 307 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 CGB2Q6NT52 195 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 C3orf33Q6P1S2 294 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 PAMR1Q6UXH9 720 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 RNF130Q86XS8 419 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF619Q8N2I2 560 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 DPP10Q8N608 796 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF610Q8N9Z0 462 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF511Q8NB15 262 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 FAM71CQ8NEG0 241 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 RNF128Q8TEB7 428 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 ZFP90Q8TF47 636 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 ST8SIA1Q92185 356 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 GTF2H4Q92759 462 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 OSTF1Q92882 214 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF524Q96C55 264 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 CMTM5Q96DZ9 223 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 ARSGQ96EG1 525 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 OCSTAMPQ9BR26 566 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 INPP5KQ9BT40 448 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 MED18Q9BUE0 208 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 SRXN1Q9BYN0 137 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 LAT2Q9GZY6 243 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 COQ10BQ9H8M1 238 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 TPT1P8Q9HAU6 139 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 GLRX2Q9NS18 164 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 KLHL28Q9NXS3 571 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 ELOVL5Q9NYP7 299 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 EDARQ9UNE0 448 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 AP3M1Q9Y2T2 418 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 FREM1Q5H8C1 2179 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 ACANP16112 2415 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 C16orf97H3BN30 126 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 NDUFAB1O14561 156 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 CASKO14936 926 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 SNX3O60493 162 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 DNAJA2O60884 412 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 DCTN3O75935 186 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 PGCP20142 388 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 DNASE1P24855 282 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 PGM1P36871 562 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 MERTKQ12866 999 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 SYPL1Q16563 259 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 MMEL1Q495T6 779 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 LRIF1Q5T3J3 769 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 FCRLAQ7L513 359 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF550Q7Z398 422 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 HMGN2P46Q86SG4 172 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 SLC30A8Q8IWU4 369 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 ANKS4BQ8N8V4 417 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 ANKFN1Q8N957 763 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 OR9I1Q8NGQ6 314 aa6.84□□□□□ -1.31
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