RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa24.91■■□□□ 1.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A087WUU8 490 aa24.91■■□□□ 1.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 B4DXG7 233 aa24.91■■□□□ 1.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 SOCS2O14508 198 aa24.91■■□□□ 1.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 EI24O14681 340 aa24.91■■□□□ 1.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 LYPD3O95274 346 aa24.91■■□□□ 1.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRKCAP17252 672 aa24.91■■□□□ 1.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 RBM34P42696 430 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 PLGLB1Q02325 96 aa24.91■■□□□ 1.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 SEC23BQ15437 767 aa24.91■■□□□ 1.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 PLPPR5Q32ZL2 321 aa24.91■■□□□ 1.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 PPP4R4Q6NUP7 873 aa24.91■■□□□ 1.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 POMZP3Q6PJE2 187 aa24.91■■□□□ 1.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 TBPL2Q6SJ96 375 aa24.91■■□□□ 1.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 PACRGLQ8N7B6 248 aa24.91■■□□□ 1.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR4K5Q8NGD3 323 aa24.91■■□□□ 1.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 SCMH1Q96GD3 660 aa24.91■■□□□ 1.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 FUZQ9BT04 418 aa24.91■■□□□ 1.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa24.91■■□□□ 1.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF556Q9HAH1 456 aa24.91■■□□□ 1.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 MED31Q9Y3C7 131 aa24.91■■□□□ 1.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A087WUJ7 227 aa24.9■■□□□ 1.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARRDC5A6NEK1 342 aa24.9■■□□□ 1.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 ITGB2P05107 769 aa24.9■■□□□ 1.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 ANXA8P13928 327 aa24.9■■□□□ 1.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 MST1P26927 711 aa24.9■■□□□ 1.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 EIF1P41567 113 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 DAG1Q14118 895 aa24.9■■□□□ 1.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 IGFL3Q6UXB1 125 aa24.9■■□□□ 1.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa24.9■■□□□ 1.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 PIGXQ8TBF5 258 aa24.9■■□□□ 1.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 EXTL1Q92935 676 aa24.9■■□□□ 1.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZBTB8AQ96BR9 441 aa24.9■■□□□ 1.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 MRGPRX4Q96LA9 322 aa24.9■■□□□ 1.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 OSGIN1Q9UJX0 560 aa24.9■■□□□ 1.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 C15orf41Q9Y2V0 281 aa24.9■■□□□ 1.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 ORC6Q9Y5N6 252 aa24.9■■□□□ 1.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 FRYQ5TBA9 3013 aa24.89■■□□□ 1.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 HK1P19367 917 aa24.89■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 MEOX1P50221 254 aa24.89■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 ALDH3A2P51648 485 aa24.89■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 WDR88Q6ZMY6 472 aa24.89■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 AQP11Q8NBQ7 271 aa24.89■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR9Q2Q8NGE9 314 aa24.89■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF524Q96C55 264 aa24.89■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 FEVQ99581 238 aa24.89■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC29A1Q99808 456 aa24.89■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 SMURF2Q9HAU4 748 aa24.89■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 HEATR5AQ86XA9 2040 aa24.88■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa24.88■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 PINLYPA6NC86 204 aa24.88■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 LRRC3CA6NJW4 275 aa24.88■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 GDF1P27539 372 aa24.88■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 UGT2B15P54855 530 aa24.88■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 FOXO1Q12778 655 aa24.88■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 FOXF1Q12946 379 aa24.88■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 CDK20Q8IZL9 346 aa24.88■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 PSD2Q9BQI7 771 aa24.88■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 SERINC1Q9NRX5 453 aa24.88■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 MGAT4BQ9UQ53 548 aa24.88■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMED7Q9Y3B3 224 aa24.88■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 CSAG2Q9Y5P2 127 aa24.88■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 HPRP00739 348 aa24.87■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCNA2P20248 432 aa24.87■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 PTNP21246 168 aa24.87■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 SRD5A2P31213 254 aa24.87■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC25A53Q5H9E4 307 aa24.87■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 LINC00114Q6XXX2 140 aa24.87■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 NRMQ8IXM6 262 aa24.87■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRAPPC6AO75865 159 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 NTN1O95631 604 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 DLX5P56178 289 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 IL1RL1Q01638 556 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC19A3Q9BZV2 496 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 USE1Q9NZ43 259 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 SUSD5O60279 629 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 ALPLP05186 524 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 IGFBP5P24593 272 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 ADH6P28332 368 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 PPP2R2BQ00005 443 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 RAET1LQ5VY80 246 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAHD1Q6P587 224 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 IZUMO2Q6UXV1 221 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR14L1PQ8NHC6 308 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms