RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293373.10

NCKAP1L-201, Transcript of NCK associated protein 1 like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NCKAP1L, Length 9,016 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1L-201ENST00000293373 WNT4P56705 351 aa7.3□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 HBMQ6B0K9 141 aa7.3□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 AWAT2Q6E213 333 aa7.3□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 BHLHA9Q7RTU4 235 aa7.3□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 TMEM150AQ86TG1 271 aa7.3□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 RNF175Q8N4F7 328 aa7.3□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 RAB39BQ96DA2 213 aa7.3□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 C16orf58Q96GQ5 468 aa7.3□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 SLC41A2Q96JW4 573 aa7.3□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 ALG8Q9BVK2 526 aa7.3□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 SLC6A20Q9NP91 592 aa7.3□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 PEX11BO96011 259 aa7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 MT-CO3P00414 261 aa7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 MS4A2Q01362 244 aa7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 CHRNEQ04844 493 aa7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 SLC36A2Q495M3 483 aa7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 RTL6Q6ICC9 239 aa7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 TMEM207Q6UWW9 146 aa7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 NDUFAF7Q7L592 441 aa7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 AAED1Q7RTV5 226 aa7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 HCAR1Q9BXC0 346 aa7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 SLC35F4A4IF30 521 aa7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 C5orf51A6NDU8 294 aa7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 FBP2O00757 339 aa7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 TNFSF15O95150 251 aa7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 VAMP5O95183 116 aa7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 LPLP06858 475 aa7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 ZFP69Q49AA0 526 aa7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 LINC00696Q6ZRV3 163 aa7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 RCBTB1Q8NDN9 531 aa7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 ABCG2Q9UNQ0 655 aa7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 PLSCR5A0PG75 271 aa7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 FPR3P25089 353 aa7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 HOXC5Q00444 222 aa7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 TMEM69Q5SWH9 247 aa7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 ATAD3CQ5T2N8 411 aa7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 GRINAQ7Z429 371 aa7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 FBXL6Q8N531 539 aa7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 OR5T2Q8NGG2 359 aa7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 GPR148Q8TDV2 347 aa7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 ISOC1Q96CN7 298 aa7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 GPR52Q9Y2T5 361 aa7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 TRAV27A0A087WT01 109 aa7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 ARGFXA6NJG6 315 aa7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 CSO75390 466 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 DIRAS3O95661 229 aa7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 NUDT7P0C024 238 aa7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 FAM111BQ6SJ93 734 aa7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 ZNF554Q86TJ5 538 aa7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 KCNE4Q8WWG9 221 aa7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 RFT1Q96AA3 541 aa7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 FBXO4Q9UKT5 387 aa7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 OR14I1A6ND48 311 aa7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 ADH7P40394 386 aa7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 ATP1B3P54709 279 aa7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 B3GNT7Q8NFL0 401 aa7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 CPT1CQ8TCG5 803 aa7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 DNAJA3Q96EY1 480 aa7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 GIMAP5Q96F15 307 aa7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 LRFN5Q96NI6 719 aa7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 CDCP1Q9H5V8 836 aa7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 ZNF587BE7ETH6 402 aa7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 CD22P20273 847 aa7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 PPICP45877 212 aa7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 STK11Q15831 433 aa7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 ZNF628Q5EBL2 1059 aa7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 SLC16A14Q7RTX9 510 aa7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 POTEKPQ9BYX7 375 aa7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 SELPLGQ14242 412 aa7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 OR4N4Q8N0Y3 316 aa7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 SAP130Q9H0E3 1048 aa7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 KCNS2Q9ULS6 477 aa7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 OR51B4Q9Y5P0 310 aa7.29□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 MTHFD2P13995 350 aa7.28□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 ST6GAL1P15907 406 aa7.28□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 PITPNBP48739 271 aa7.28□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 ACTBP60709 375 aa7.28□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 ACTG1P63261 375 aa7.28□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 IL11RAQ14626 422 aa7.28□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 PLAG1Q6DJT9 500 aa7.28□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 CAMKMTQ7Z624 323 aa7.28□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 ZNF683Q8IZ20 524 aa7.28□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 DYNLRB1Q9NP97 96 aa7.28□□□□□ -1.24
NCKAP1L-201ENST00000293373 LHX6Q9UPM6 363 aa7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.5 ms