RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa20.34■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 ZNF561Q8N587 486 aa20.34■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 RGMAQ96B86 450 aa20.34■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 TBC1D17Q9HA65 648 aa20.34■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 SEMA3GQ9NS98 782 aa20.34■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 OARD1Q9Y530 152 aa20.34■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa20.34■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 ABOP16442 354 aa20.34■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 BLOC1S1P78537 153 aa20.34■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa20.34■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 ZNF485Q8NCK3 441 aa20.34■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 FUZQ9BT04 418 aa20.34■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 TPT1P8Q9HAU6 139 aa20.34■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa20.33■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 SNRPGP15A8MWD9 76 aa20.33■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 TIMP2P16035 220 aa20.33■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 NOS3P29474 1203 aa20.33■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 GMFBP60983 142 aa20.33■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 RAB40BQ12829 278 aa20.33■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 Q6ZVL8 140 aa20.33■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 C11orf65Q8NCR3 313 aa20.33■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 C1GALT1Q9NS00 363 aa20.33■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 ZNF69Q9UC07 566 aa20.33■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 FZD4Q9ULV1 537 aa20.33■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa20.33■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 LRRN3E7EW58 273 aa20.33■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 AGAP20933 346 aa20.33■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 LTBRP36941 435 aa20.33■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 DGKGP49619 791 aa20.33■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 SYT14P1Q58G82 188 aa20.33■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 ELFN2Q5R3F8 820 aa20.33■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 ZNF626Q68DY1 528 aa20.33■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 FAM111BQ6SJ93 734 aa20.33■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 NHLRC1Q6VVB1 395 aa20.33■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 LHFPL3Q86UP9 236 aa20.33■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 CFAP206Q8IYR0 622 aa20.33■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 FGF13Q92913 245 aa20.33■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 LRRN3Q9H3W5 708 aa20.33■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 GDE1Q9NZC3 331 aa20.33■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 ADH5P11766 374 aa20.32■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 RAD52P43351 418 aa20.32■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa20.32■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 NPAS3Q8IXF0 933 aa20.32■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 OR51Q1Q8NH59 317 aa20.32■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 C2orf88Q9BSF0 95 aa20.32■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 OR10A4Q9H209 315 aa20.32■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 CTPS2Q9NRF8 586 aa20.32■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 CORO2BQ9UQ03 480 aa20.32■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 CD8B2A6NJW9 211 aa20.32■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 ZNF879B4DU55 563 aa20.32■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 CLDN4O14493 209 aa20.32■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 OPN1SWP03999 348 aa20.32■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 HEXBP07686 556 aa20.32■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 POU2F2P09086 479 aa20.32■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 CD8BP10966 210 aa20.32■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 TACR1P25103 407 aa20.32■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 ITGA3P26006 1051 aa20.32■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 METAP1P53582 386 aa20.32■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 ARHGEF7Q14155 803 aa20.32■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 CCDC116Q8IYX3 515 aa20.32■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 C15orf54Q8N8G6 183 aa20.32■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 OR10H5Q8NGA6 315 aa20.32■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa20.32■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 SLC25A28Q96A46 364 aa20.32■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 MEGF10Q96KG7 1140 aa20.32■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 ZNF354BQ96LW1 612 aa20.32■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 EGFL8Q99944 293 aa20.32■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 FAM117AQ9C073 453 aa20.32■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 TAS2R5Q9NYW4 299 aa20.32■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 IL5P05113 134 aa20.31■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 OR8U8P0C7N1 319 aa20.31■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 HTR2AP28223 471 aa20.31■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 SOX18P35713 384 aa20.31■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 DLX5P56178 289 aa20.31■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP20.31■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 VRK3Q8IV63 474 aa20.31■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 MAL2Q969L2 176 aa20.31■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 RNFT2Q96EX2 444 aa20.31■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 LRR1Q96L50 414 aa20.31■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 MFFQ9GZY8 342 aa20.31■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 CHRDQ9H2X0 955 aa20.31■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 TMEM265A0A087WTH1 108 aa20.31■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 PRRT4C9JH25 899 aa20.31■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 TCAPO15273 167 aa20.31■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 SOX14O95416 240 aa20.31■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 ACP2P11117 423 aa20.31■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 SDC1P18827 310 aa20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms