RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000089378.4

Sh3bp1-203, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Opn1mwO35599 359 aa19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Papss2O88428 621 aa19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Galr3O88853 370 aa19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 P01654 111 aa19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 P01656 111 aa19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 P03977 111 aa19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tmem217Q14AF1 189 aa19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tcfl5Q32NY8 489 aa19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nhlrc4Q3UP44 136 aa19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pla2g7Q60963 440 aa19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr645Q7TRQ1 315 aa19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mmd2Q8R189 247 aa19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr583Q8VG25 319 aa19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Clec2dQ91V08 207 aa19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lrrc49Q91YK0 686 aa19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc35b3Q922Q5 369 aa19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gid4Q9CPY6 217 aa19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zfp873A0A1B0GT64 667 aa19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ddi2A2ADY9 399 aa19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Esp18A8R0V1 91 aa19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm21897J3KMP5 500 aa19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zfp994J3QM38 661 aa19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm21750L7N228 499 aa19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dbil5O09035 87 aa19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Clk4O35493 481 aa19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Atxn2O70305 1285 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Uck1P52623 277 aa19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr1167Q7TR26 316 aa19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Luzp2Q8BGY3 345 aa19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nyap2Q8BM65 682 aa19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gpr152Q8BXS7 511 aa19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 H2afy2Q8CCK0 372 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Unc5dQ8K1S2 956 aa19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Grk5Q8VEB1 590 aa19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn1r85Q8VIB8 308 aa19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Atp5f1Q9CQQ7 256 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dimt1Q9D0D4 313 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Elovl4Q9EQC4 312 aa19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pole3Q9JKP7 145 aa19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Igkv12-38A0A0G2JEI7 115 aa19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 5430401F13RikE9Q328 175 aa19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zp3P10761 424 aa19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Klk1b9P15949 261 aa19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Btbd3P58545 530 aa19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 MakQ04859 622 aa19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 BocQ6AZB0 1110 aa19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm5346Q7M766 736 aa19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 IfnkQ7TSL0 199 aa19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gpr68Q8BFQ3 365 aa19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Q8BHG2 160 aa19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cpne1Q8C166 536 aa19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rad51ap1Q8C551 337 aa19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn1r219Q8R271 312 aa19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr1226Q8VGM5 310 aa19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr683Q8VGV1 319 aa19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tmem63aQ91YT8 804 aa19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 NrarpQ91ZA8 114 aa19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 BniplQ99JU7 328 aa19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gpn3Q9D3W4 284 aa19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tmem38bQ9DAV9 292 aa19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Phyhd1Q9DB26 291 aa19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc25a18Q9DB41 320 aa19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sacm1lQ9EP69 587 aa19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Trim3Q9R1R2 744 aa19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ms4a7E9Q9V5 267 aa19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 HexaP29416 528 aa19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Six5P70178 719 aa19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mmp25Q3U435 615 aa19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rims3Q80U57 307 aa19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hs6st2Q80UW0 612 aa19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 H2-M10.5Q85ZW7 330 aa19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rhbdd3Q8BP97 385 aa19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 B4gat1Q8BWP8 415 aa19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fem1abQ8C0T1 654 aa19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr692Q8VF03 329 aa19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Clec2fQ8VI21 196 aa19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc25a36Q922G0 311 aa19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Abtb1Q99LJ2 478 aa19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cthrc1Q9D1D6 245 aa19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Minpp1Q9Z2L6 481 aa19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tmem201A2A8U2 664 aa19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn2r110E9PWD5 858 aa19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn1r12G5E8G1 307 aa19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Msx1P13297 303 aa19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr6P34986 316 aa19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Wnt11P48615 354 aa19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 SelenoiQ80TA1 398 aa19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 1700001J03RikQ80ZR8 219 aa19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pou6f2Q8BJI4 691 aa19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Esrp2Q8K0G8 717 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc22a22Q8R0S9 554 aa19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr883Q8VF64 309 aa19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cacng6Q8VHW3 260 aa19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lrg1Q91XL1 342 aa19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 LsrQ99KG5 594 aa19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Krt88Q9CPR6 171 aa19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 P2ry12Q9CPV9 347 aa19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PinlypQ9CQD7 212 aa19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sesn3Q9CYP7 492 aa19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ccdc107Q9DCC3 242 aa19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 54.1 ms