RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638481.1

SPIN3-208, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5

Gene SPIN3, Length 2,050 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-208	ENST00000638481	PRAMEF7	Q5VXH5	474 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	ZCCHC12	Q6PEW1	402 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	FRRS1	Q6ZNA5	592 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	PHC2	Q8IXK0	858 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	CLDN22	Q8N7P3	220 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	PRSS33	Q8NF86	280 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	PMEPA1	Q969W9	287 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	WFDC6	Q9BQY6	131 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	VN1R1	Q9GZP7	353 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	FOLH1B	Q9HBA9	442 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	TVP23B	Q9NYZ1	205 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	MKL2	Q9ULH7	1088 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	TCRBV16S1A1N1	A0A5B0	115 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481		A8MUA0	341 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	SEMA7A	O75326	666 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	IL7	P13232	177 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	TNNI3	P19429	210 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	RFX2	P48378	723 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	PSG6	Q00889	435 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	FUT7	Q11130	342 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	ARHGAP11B	Q3KRB8	267 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	KLHL22	Q53GT1	634 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	NXNL2	Q5VZ03	156 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	ZNF385C	Q66K41	422 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	NANOGNB	Q7Z5D8	188 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	LAX1	Q8IWV1	398 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	COX18	Q8N8Q8	333 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	OR52I1	Q8NGK6	324 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	STT3B	Q8TCJ2	826 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	PTPMT1	Q8WUK0	201 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	SLC25A46	Q96AG3	418 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	STAC	Q99469	402 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	PELO	Q9BRX2	385 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	FNDC11	Q9BVV2	318 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	PARD6A	Q9NPB6	346 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	CALML5	Q9NZT1	146 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	SLC9A8	Q9Y2E8	581 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	GXYLT2	A0PJZ3	443 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-208	ENST00000638481	C4orf47	A7E2U8	309 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-208	ENST00000638481	POLR1C	O15160	346 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-208	ENST00000638481	PRAMEF2	O60811	474 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-208	ENST00000638481	CYP7B1	O75881	506 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-208	ENST00000638481	CDRT1	O95170	752 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-208	ENST00000638481	EPPIN	O95925	133 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-208	ENST00000638481	CLPS	P04118	112 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-208	ENST00000638481	TP53	P04637	393 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-208	ENST00000638481	CPE	P16870	476 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-208	ENST00000638481	GALNS	P34059	522 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-208	ENST00000638481	GABRA3	P34903	492 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-208	ENST00000638481	CLDN6	P56747	220 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-208	ENST00000638481	IL11RA	Q14626	422 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-208	ENST00000638481	CDK10	Q15131	360 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-208	ENST00000638481	NSDHL	Q15738	373 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-208	ENST00000638481	C3orf38	Q5JPI3	329 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-208	ENST00000638481	DCST2	Q5T1A1	773 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-208	ENST00000638481	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-208	ENST00000638481	TYW3	Q6IPR3	259 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-208	ENST00000638481	XKRX	Q6PP77	449 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-208	ENST00000638481	RBM45	Q8IUH3	476 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-208	ENST00000638481	ASCC1	Q8N9N2	400 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-208	ENST00000638481	OR4D11	Q8NGI4	311 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-208	ENST00000638481	C16orf52	Q8NHV5	167 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-208	ENST00000638481	SLC7A13	Q8TCU3	470 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-208	ENST00000638481	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-208	ENST00000638481	VSTM2L	Q96N03	204 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-208	ENST00000638481	SDF2	Q99470	211 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-208	ENST00000638481	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-208	ENST00000638481	SLC22A4	Q9H015	551 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-208	ENST00000638481	OR10A5	Q9H207	317 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-208	ENST00000638481	FBXO34	Q9NWN3	711 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-208	ENST00000638481	A4GNT	Q9UNA3	340 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-208	ENST00000638481	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-208	ENST00000638481	DMXL1	Q9Y485	3027 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-208	ENST00000638481	IGLV3-12	A0A075B6K2	115 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SPIN3-208	ENST00000638481	HMX3	A6NHT5	357 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SPIN3-208	ENST00000638481	SNTN	A6NMZ2	147 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SPIN3-208	ENST00000638481	TLX2	O43763	284 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SPIN3-208	ENST00000638481	PRKY	O43930	277 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SPIN3-208	ENST00000638481	NKX2-2	O95096	273 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SPIN3-208	ENST00000638481	ZNF28	P17035	718 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SPIN3-208	ENST00000638481	MYL12A	P19105	171 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SPIN3-208	ENST00000638481	GSTM3	P21266	225 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SPIN3-208	ENST00000638481	RORA	P35398	523 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SPIN3-208	ENST00000638481	DCD	P81605	110 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SPIN3-208	ENST00000638481	BIK	Q13323	160 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SPIN3-208	ENST00000638481	ASAH1	Q13510	395 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SPIN3-208	ENST00000638481	ZNF79	Q15937	498 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SPIN3-208	ENST00000638481	LCN10	Q6JVE6	187 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SPIN3-208	ENST00000638481	PODNL1	Q6PEZ8	512 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SPIN3-208	ENST00000638481	FIGNL1	Q6PIW4	674 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SPIN3-208	ENST00000638481	HSDL2	Q6YN16	418 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SPIN3-208	ENST00000638481	VASH1	Q7L8A9	365 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SPIN3-208	ENST00000638481	VRK2	Q86Y07	508 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SPIN3-208	ENST00000638481	ZNF321P	Q8N8H1	164 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SPIN3-208	ENST00000638481	ZNF615	Q8N8J6	731 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SPIN3-208	ENST00000638481	ZNF578	Q96N58	590 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SPIN3-208	ENST00000638481	TGIF2	Q9GZN2	237 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SPIN3-208	ENST00000638481	ZNF350	Q9GZX5	532 aa		13.76	□□□□□ -0.21

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