RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637100.1

CLN3-255, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLN3, Length 1,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-255ENST00000637100 TTKP33981 857 aa14.49□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 SKP2Q13309 424 aa14.49□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 PCLAFQ15004 111 aa14.49□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 QPRTQ15274 297 aa14.49□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa14.49□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 ALKBH2Q6NS38 261 aa14.49□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 C3orf33Q6P1S2 294 aa14.49□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 TMPPEQ6ZT21 453 aa14.49□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 SZRD1Q7Z422 152 aa14.49□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 GALNT5Q7Z7M9 940 aa14.49□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 C10orf107Q8IVU9 208 aa14.49□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 RIMKLAQ8IXN7 391 aa14.49□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 OR7A2PQ8NGA2 310 aa14.49□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 ADAMTS15Q8TE58 950 aa14.49□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 OIT3Q8WWZ8 545 aa14.49□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 ST8SIA1Q92185 356 aa14.49□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 JADE3Q92613 823 aa14.49□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 MOAP1Q96BY2 351 aa14.49□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 MUCL1Q96DR8 90 aa14.49□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 HS6ST2Q96MM7 605 aa14.49□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa14.49□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 RHNO1Q9BSD3 238 aa14.49□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 LAT2Q9GZY6 243 aa14.49□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 PPCSQ9HAB8 311 aa14.49□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 MGAT4BQ9UQ53 548 aa14.49□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 ALPK2Q86TB3 2170 aa14.49□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa14.48□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 SERINC4A6NH21 518 aa14.48□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 TMEM114B3SHH9 223 aa14.48□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 H7C417 338 aa14.48□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 ABCD4O14678 606 aa14.48□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 TRIM13O60858 407 aa14.48□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 NUDT14O95848 222 aa14.48□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 SLC7A1P30825 629 aa14.48□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 CDH11P55287 796 aa14.48□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 TMEM249Q2WGJ8 235 aa14.48□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 NDUFAF6Q330K2 333 aa14.48□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa14.48□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 FBXW9Q5XUX1 488 aa14.48□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 CEP112Q8N8E3 955 aa14.48□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 FAM71CQ8NEG0 241 aa14.48□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 MUS81Q96NY9 551 aa14.48□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 DHRS9Q9BPW9 319 aa14.48□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa14.48□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 ALG2Q9H553 416 aa14.48□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 CBLN4Q9NTU7 201 aa14.48□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa14.48□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 TRAF6Q9Y4K3 522 aa14.48□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 SLC25A15Q9Y619 301 aa14.48□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 PDLIM1O00151 329 aa14.47□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 SSX4O60224 188 aa14.47□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 CHEK2O96017 543 aa14.47□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 UBL4AP11441 157 aa14.47□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 PTAFRP25105 342 aa14.47□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 NTF4P34130 210 aa14.47□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 HPCAL1P37235 193 aa14.47□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 DIO1P49895 249 aa14.47□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 SLC16A1P53985 500 aa14.47□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 CBFBQ13951 182 aa14.47□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 TIGD2Q4W5G0 525 aa14.47□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 TMEM108Q6UXF1 575 aa14.47□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 TWIST2Q8WVJ9 160 aa14.47□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 ARL8AQ96BM9 186 aa14.47□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 PPP3R2Q96LZ3 170 aa14.47□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 OR7D2Q96RA2 312 aa14.47□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 ACER3Q9NUN7 267 aa14.47□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 MKS1Q9NXB0 559 aa14.47□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 MALT1Q9UDY8 824 aa14.47□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 MID2Q9UJV3 735 aa14.47□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 PIP5K1BO14986 540 aa14.46□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 DNPH1O43598 174 aa14.46□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 NPHS1O60500 1241 aa14.46□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 AK1P00568 194 aa14.46□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 SHBGP04278 402 aa14.46□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 SLC25A16P16260 332 aa14.46□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 MAPK1P28482 360 aa14.46□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 SESN3P58005 492 aa14.46□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 H3F3AP84243 136 aa14.46□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 GALNTL6Q49A17 601 aa14.46□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 C6orf136Q5SQH8 315 aa14.46□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa14.46□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 MIPOL1Q8TD10 442 aa14.46□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 BOD1Q96IK1 185 aa14.46□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 OR5B2Q96R09 309 aa14.46□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 CACNG6Q9BXT2 260 aa14.46□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 SERHL2Q9H4I8 314 aa14.46□□□□□ -0.09
CLN3-255ENST00000637100 ATAD3AQ9NVI7 634 aa14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.2 ms