RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 UBQLNLQ8IYU4 475 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 DNAJC22Q8N4W6 341 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 DHRS1Q96LJ7 313 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 ABCG5Q9H222 651 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 ERVK13-1Q9NX77 482 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 CA5BQ9Y2D0 317 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 SCN4AP35499 1836 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 A0A1W2PPK0 400 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 OR5K3A6NET4 321 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 VNN2O95498 520 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 CHRNEQ04844 493 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 CAMK2DQ13557 499 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 SLC35D3Q5M8T2 416 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 TMEM150AQ86TG1 271 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 SPAG16Q8N0X2 631 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF454Q8N9F8 522 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 OR5D14Q8NGL3 314 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 OR5H2Q8NGV7 314 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 CHPT1Q8WUD6 406 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 SOX3P41225 446 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 BMXP51813 675 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 ERVK-25P63136 954 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 TEKQ02763 1124 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 C3orf33Q6P1S2 294 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 FUNDC1Q8IVP5 155 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 EDAQ92838 391 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 C4orf36Q96KX1 117 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 LRFN5Q96NI6 719 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 CDH20Q9HBT6 801 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 SLC6A20Q9NP91 592 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 FAIMQ9NVQ4 179 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 CACNG2Q9Y698 323 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa6.02□□□□□ -1.44
PDE4D-228ENST00000636120 TRAV27A0A087WT01 109 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 LYRM1O43325 122 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 SUSD5O60279 629 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 HOXC8P31273 242 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 MEF2DQ14814 521 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 SHHQ15465 462 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 TMEM201Q5SNT2 666 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 RAB12Q6IQ22 244 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 LIX1LQ8IVB5 337 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 MYLIPQ8WY64 445 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 TM9SF4Q92544 642 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 ADOQ96SZ5 270 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 OR10A4Q9H209 315 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 IL21Q9HBE4 155 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 C12orf4Q9NQ89 552 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 WASH6PQ9NQA3 447 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 TMEM30AQ9NV96 361 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 KCNIP1Q9NZI2 227 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 MGAT4CQ9UBM8 478 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 POLHQ9Y253 713 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 FRS3O43559 492 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 CSF2P04141 144 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 SCG5P05408 212 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 MYOGP15173 224 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 RPS5P46782 204 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 CD97P48960 835 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 HSD17B7P56937 341 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 ZP2Q05996 745 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 C17orf67Q0P5P2 114 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 ACSM3Q53FZ2 586 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 METTL11BQ5VVY1 283 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 MFSD12Q6NUT3 480 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 GSG1LQ6UXU4 331 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 DLEU7Q6UYE1 221 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 RNF165Q6ZSG1 346 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 SH2D5Q6ZV89 423 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 EID2Q8N6I1 236 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 GALNT6Q8NCL4 622 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 OR13H1Q8NG92 308 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 SYT3Q9BQG1 590 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 WIF1Q9Y5W5 379 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 LOC100509620A0A075B734 347 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF850A8MQ14 1090 aa6.02□□□□□ -1.45
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