RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	FAM53B	Q14153	422 aa		12.09	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	NDUFAF6	Q330K2	333 aa		12.09	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	RNF44	Q7L0R7	432 aa		12.09	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	OR5W2	Q8NH69	310 aa		12.09	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	GPBAR1	Q8TDU6	330 aa		12.09	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	PEX11G	Q96HA9	241 aa		12.09	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	GSDMC	Q9BYG8	508 aa		12.09	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	LRRN3	Q9H3W5	708 aa		12.09	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	CMC2	Q9NRP2	79 aa		12.09	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	NUFIP1	Q9UHK0	495 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152		B4DXG7	233 aa		12.09	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	PSKH1	P11801	424 aa		12.09	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	IFITM2	Q01629	132 aa		12.09	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		12.09	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	LCN1P1	Q5VSP4	162 aa		12.09	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	GARNL3	Q5VVW2	1013 aa		12.09	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	ARMC6	Q6NXE6	501 aa		12.09	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	PARG	Q86W56	976 aa		12.09	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	GALNT6	Q8NCL4	622 aa		12.09	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	CTHRC1	Q96CG8	243 aa		12.09	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	RBM18	Q96H35	190 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	C4orf36	Q96KX1	117 aa		12.09	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	TRPV5	Q9NQA5	729 aa		12.09	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152		A0A1W2PPK0	400 aa		12.08	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	RIIAD1	A6NNX1	92 aa		12.08	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	IGHV4-34	P06331	123 aa		12.08	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	THEGL	P0DJG4	465 aa		12.08	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	TCEA1	P23193	301 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	MYL9	P24844	172 aa		12.08	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	EVX1	P49640	407 aa		12.08	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	PGD	P52209	483 aa		12.08	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	OR12D2	P58182	307 aa		12.08	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	ACSM1	Q08AH1	577 aa		12.08	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	STX4	Q12846	297 aa		12.08	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	TMPRSS11F	Q6ZWK6	438 aa		12.08	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	ARL14	Q8N4G2	192 aa		12.08	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	C17orf47	Q8NEP4	570 aa		12.08	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		12.08	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	SPACA7	Q96KW9	195 aa		12.08	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	TTYH2	Q9BSA4	534 aa		12.08	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	PPP1R3E	Q9H7J1	279 aa		12.08	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		12.08	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	KLHL1	Q9NR64	748 aa		12.08	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	BOLA1	Q9Y3E2	137 aa		12.08	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152		A0A0B4J2E0	115 aa		12.08	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152		A0A1B0GX12	115 aa		12.08	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	OR5K3	A6NET4	321 aa		12.08	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	SLC9B1P1	A6NJY1	282 aa		12.08	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	IDH3B	O43837	385 aa		12.08	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	RGS9	O75916	674 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	MAP3K8	P41279	467 aa		12.08	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	OR10A3	P58181	314 aa		12.08	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	ZFP69	Q49AA0	526 aa		12.08	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	GXYLT1	Q4G148	440 aa		12.08	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152		Q6ZS52	159 aa		12.08	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		12.08	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	SDR9C7	Q8NEX9	313 aa		12.08	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	OR4K13	Q8NH42	304 aa		12.08	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	RIT1	Q92963	219 aa		12.08	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	TOE1	Q96GM8	510 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		12.08	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	COQ7	Q99807	217 aa		12.08	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	FN3K	Q9H479	309 aa		12.08	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	ASB6	Q9NWX5	421 aa		12.08	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	POLH	Q9Y253	713 aa		12.08	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152		A0A0B4J293	547 aa		12.08	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	SLC22A31	A6NKX4	558 aa		12.08	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	TGFBR3L	H3BV60	316 aa		12.08	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	NKX2-2	O95096	273 aa		12.08	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	SLC35E2	P0CK97	266 aa		12.08	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	ELK1	P19419	428 aa		12.08	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	DRD5	P21918	477 aa		12.08	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	RABIF	P47224	123 aa		12.08	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	INPP1	P49441	399 aa		12.08	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	RAB38	P57729	211 aa		12.08	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	BTG2	P78543	158 aa		12.08	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	GALE	Q14376	348 aa		12.08	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	ZCCHC12	Q6PEW1	402 aa		12.08	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	PAMR1	Q6UXH9	720 aa		12.08	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		12.08	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	OR13C5	Q8NGS8	318 aa		12.08	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	RLN3	Q8WXF3	142 aa		12.08	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	RNF31	Q96EP0	1072 aa		12.08	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	FRMD6	Q96NE9	622 aa		12.08	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF559	Q9BR84	538 aa		12.08	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	NDC1	Q9BTX1	674 aa		12.08	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	GPR174	Q9BXC1	333 aa		12.08	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	KCNN2	Q9H2S1	579 aa		12.08	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	FOLH1B	Q9HBA9	442 aa		12.08	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	NPAP1	Q9NZP6	1156 aa		12.08	□□□□□ -0.48

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