RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF563Q8TA94 476 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 METTL7AQ9H8H3 244 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 CNIH4Q9P003 139 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 MED31Q9Y3C7 131 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 GMPPBQ9Y5P6 360 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 C2orf72A6NCS6 295 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 PTNP21246 168 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 CHMP24386 653 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 FPR3P25089 353 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 MYBPC1Q00872 1141 aa22.69■■□□□ 1.22
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CAPNS1-215ENST00000628018 COL28A1Q2UY09 1125 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 ACER2Q5QJU3 275 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 VASH2Q86V25 355 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 PFN4Q8NHR9 129 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 GPR119Q8TDV5 335 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 NXPE2Q96DL1 559 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 ADAM19Q9H013 955 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 SH2D2AQ9NP31 389 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 SDHAF3Q9NRP4 125 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 PNPLA3Q9NST1 481 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 WIF1Q9Y5W5 379 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 B4DXG7 233 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 GMFGO60234 142 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 CTBP2P56545 445 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 ISL1P61371 349 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 MEP1AQ16819 746 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 THAP5Q7Z6K1 395 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 C12orf10Q9HB07 376 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 CPNE5Q9HCH3 593 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 C20orf141Q9NUB4 165 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 ANKUB1A6NFN9 424 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 NUDT14O95848 222 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 LYNP07948 512 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 PNMTP11086 282 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 GPR4P46093 362 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 OR5M10Q6IEU7 315 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 SETD9Q8NE22 299 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 PAQR8Q8TEZ7 354 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 NTNG2Q96CW9 530 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 FRMD6Q96NE9 622 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 HPF1Q9NWY4 346 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM5Q9Y2B1 443 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa22.67■■□□□ 1.22
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CAPNS1-215ENST00000628018 ZAR1LA6NP61 321 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 SOX14O95416 240 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 IFI30P13284 250 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 MSX1P28360 303 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 GGT2P36268 569 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 TBC1D25Q3MII6 688 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC30A6Q6NXT4 461 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 APOL4Q9BPW4 351 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 MAKP20794 623 aa22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 TACR3P29371 465 aa22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 QPRTQ15274 297 aa22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 KIF18BQ86Y91 864 aa22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 BPIFA2Q96DR5 249 aa22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 SGCZQ96LD1 299 aa22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 ANGPTL4Q9BY76 406 aa22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 LHPPQ9H008 270 aa22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 HHATLQ9HCP6 504 aa22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 MED11Q9P086 117 aa22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 KLK13Q9UKR3 277 aa22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 HRH3Q9Y5N1 445 aa22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 H3BN98 237 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 CDC42EP2O14613 210 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 GNB5O14775 395 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 CCL3P10147 92 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 GP1BBP13224 206 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 POU1F1P28069 291 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 CD47Q08722 323 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 CLN3Q13286 438 aa22.65■■□□□ 1.22
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