RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618056.4

PMS1-220, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-220ENST00000618056 GUSBP1Q15486 140 aa22.33■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 HBMQ6B0K9 141 aa22.33■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 MSRB3Q8IXL7 192 aa22.33■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 WDR60Q8WVS4 1066 aa22.33■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 CCDC134Q9H6E4 229 aa22.33■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 SLAMF8Q9P0V8 285 aa22.33■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 PDZD2O15018 2839 aa22.33■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 CLDN24A6NM45 220 aa22.32■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 CXCL13O43927 109 aa22.32■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 AQP8O94778 261 aa22.32■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 BCHEP06276 602 aa22.32■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP22.32■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 NID1P14543 1247 aa22.32■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 CD1EP15812 388 aa22.32■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 SHC1P29353 583 aa22.32■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 SFTPDP35247 375 aa22.32■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 SLC6A8P48029 635 aa22.32■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 SESN3P58005 492 aa22.32■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 PEX5LQ8IYB4 626 aa22.32■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 ACER3Q9NUN7 267 aa22.32■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa22.32■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 VAPAQ9P0L0 249 aa22.32■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 TMEM247A6NEH6 219 aa22.31■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 IL7RP16871 459 aa22.31■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 PPIBP23284 216 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 CARD18P57730 90 aa22.31■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 GNGT1P63211 74 aa22.31■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 KIF18BQ86Y91 864 aa22.31■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 TSPEARQ8WU66 669 aa22.31■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 OSTF1Q92882 214 aa22.31■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 STARD4Q96DR4 205 aa22.31■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 TMEM19Q96HH6 336 aa22.31■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa22.31■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 A4GALTQ9NPC4 353 aa22.31■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 A0A0G2JPF8 293 aa22.3■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa22.3■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa22.3■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 MSTNO14793 375 aa22.3■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 SYNGR4O95473 234 aa22.3■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa22.3■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 SORDQ00796 357 aa22.3■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 GUCY1A3Q02108 690 aa22.3■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa22.3■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa22.3■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 C3orf33Q6P1S2 294 aa22.3■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa22.3■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 PRRG4Q9BZD6 226 aa22.3■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 TIGARQ9NQ88 270 aa22.3■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 FREM1Q5H8C1 2179 aa22.3■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 ADAM11O75078 769 aa22.29■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 NUDT7P0C024 238 aa22.29■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 TLE4Q04727 773 aa22.29■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 VWA1Q6PCB0 445 aa22.29■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa22.29■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 LUZP2Q86TE4 346 aa22.29■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 COQ10BQ9H8M1 238 aa22.29■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 MCCC2Q9HCC0 563 aa22.29■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 BCL2L10Q9HD36 194 aa22.29■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 MRGBPQ9NV56 204 aa22.29■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 MYO9AB2RTY4 2548 aa22.29■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 A8MXE2 369 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 FAAHO00519 579 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 THBS1P07996 1170 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 RYKP34925 604 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 KIR2DL3P43628 341 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 MERTKQ12866 999 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 LIN52Q52LA3 116 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 CGB2Q6NT52 195 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 DLEU7Q6UYE1 221 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 FAM214BQ7L5A3 538 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 BTLAQ7Z6A9 289 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 DPP10Q8N608 796 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 OR52P1PQ8NH57 321 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 ZNF563Q8TA94 476 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 ZNF559Q9BR84 538 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 CCDC106Q9BWC9 280 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 SERINC1Q9NRX5 453 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 GLRX2Q9NS18 164 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 PRDM4Q9UKN5 801 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 CORO2BQ9UQ03 480 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 AKAP6Q13023 2319 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 CDHR4A6H8M9 788 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 VIMP08670 466 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 GPX2P18283 190 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-220ENST00000618056 MDH1P40925 334 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
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