RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617926.4

CLTCL1-210, Transcript of clathrin heavy chain like 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CLTCL1, Length 1,695 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCL1-210ENST00000617926 LRRC17Q8N6Y2 441 aa11.96□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 OR10H4Q8NGA5 316 aa11.96□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 PFN4Q8NHR9 129 aa11.96□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 ABHD4Q8TB40 342 aa11.96□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 HGDQ93099 445 aa11.96□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 YIPF5Q969M3 257 aa11.96□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 ABHD1Q96SE0 405 aa11.96□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 ENKD1Q9H0I2 346 aa11.96□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa11.96□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa11.96□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 ADGRL4Q9HBW9 690 aa11.96□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 KCMF1Q9P0J7 381 aa11.96□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 SLC23A1Q9UHI7 598 aa11.96□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 BAIAP2Q9UQB8 552 aa11.96□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 SIGLEC7Q9Y286 467 aa11.96□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa11.96□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 LINC00862A6NCI5 91 aa11.95□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 OR52A4PA6NMU1 304 aa11.95□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 LATO43561 262 aa11.95□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 FZD7O75084 574 aa11.95□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 UBL3O95164 117 aa11.95□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 CRYZL1O95825 349 aa11.95□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 IFI6P09912 130 aa11.95□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 SBK2P0C263 348 aa11.95□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 SMIM10L1P0DMW3 83 aa11.95□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 IFI30P13284 250 aa11.95□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 PRG2P13727 222 aa11.95□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 NID1P14543 1247 aa11.95□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 GLULP15104 373 aa11.95□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 BMP7P18075 431 aa11.95□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 NDUFS1P28331 727 aa11.95□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 CTHP32929 405 aa11.95□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 MMP15P51511 669 aa11.95□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 PER3P56645 1201 aa11.95□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 NRG3P56975 720 aa11.95□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 CLDN2P57739 230 aa11.95□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 ACTC1P68032 377 aa11.95□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 ACTA1P68133 377 aa11.95□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 RGS1Q08116 209 aa11.95□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 POU4F2Q12837 409 aa11.95□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 RUNX3Q13761 415 aa11.95□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 KRT33BQ14525 404 aa11.95□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 OR1Q1Q15612 314 aa11.95□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 CST6Q15828 149 aa11.95□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 MAPK14Q16539 360 aa11.95□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 ESCO2Q56NI9 601 aa11.95□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 FAM27D1Q5T7N8 215 aa11.95□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 SIGIRRQ6IA17 410 aa11.95□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 THSD4Q6ZMP0 1018 aa11.95□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 ASB18Q6ZVZ8 466 aa11.95□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 CEACAM19Q7Z692 300 aa11.95□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 CDH24Q86UP0 819 aa11.95□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 CMIPQ8IY22 773 aa11.95□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 ZNF687Q8N1G0 1237 aa11.95□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 OR11H7Q8NGC8 314 aa11.95□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 PTP4A1Q93096 173 aa11.95□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 SMIM10Q96HG1 83 aa11.95□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 ART5Q96L15 291 aa11.95□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 TBX5Q99593 518 aa11.95□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 TEAD3Q99594 435 aa11.95□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 EVA1AQ9H8M9 152 aa11.95□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 C20orf141Q9NUB4 165 aa11.95□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 ING4Q9UNL4 249 aa11.95□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa11.95□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa11.95□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa11.95□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 TBC1D3EA0A087X179 549 aa11.94□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 CDHR4A6H8M9 788 aa11.94□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 LEUTXA8MZ59 168 aa11.94□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 DCNP07585 359 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 ANXA3P12429 323 aa11.94□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 PEPDP12955 493 aa11.94□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 AVPR2P30518 371 aa11.94□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 PDGFRLQ15198 375 aa11.94□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa11.94□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa11.94□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 CEP78Q5JTW2 689 aa11.94□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 USP53Q70EK8 1073 aa11.94□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 MS4A15Q8N5U1 240 aa11.94□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 KCT2Q8NC54 265 aa11.94□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 C17orf47Q8NEP4 570 aa11.94□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 OR4K14Q8NGD5 310 aa11.94□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa11.94□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 PMM1Q92871 262 aa11.94□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 C4orf36Q96KX1 117 aa11.94□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 SERINC2Q96SA4 455 aa11.94□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 TWSG1Q9GZX9 223 aa11.94□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 OR51J1Q9H342 316 aa11.94□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa11.94□□□□□ -0.5
CLTCL1-210ENST00000617926 NUDT15Q9NV35 164 aa11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms