RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614059.4

RPS6KC1-208, Transcript of ribosomal protein S6 kinase C1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RPS6KC1, Length 4,188 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1-208ENST00000614059 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa13.05□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 KATNBL1Q9H079 304 aa13.05□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 SGK494L7N484 410 aa13.04□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 CLRN1P58418 232 aa13.04□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 FXYD4P59646 89 aa13.04□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 SLC35D2Q76EJ3 337 aa13.04□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 CLDN22Q8N7P3 220 aa13.04□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 SMARCD2Q92925 531 aa13.04□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 PGAM5Q96HS1 289 aa13.04□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa13.04□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 PPA2Q9H2U2 334 aa13.04□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 BIN3Q9NQY0 253 aa13.04□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 HIF3AQ9Y2N7 669 aa13.04□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 TMEM72A0PK05 275 aa13.04□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 CDC14CA4D256 554 aa13.04□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 PEX14O75381 377 aa13.04□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 PET100P0DJ07 73 aa13.04□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 UGT2B7P16662 529 aa13.04□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 MMP12P39900 470 aa13.04□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 OR1Q1Q15612 314 aa13.04□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 FAM189A2Q15884 450 aa13.04□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 SFXN4Q6P4A7 337 aa13.04□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa13.04□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 LACC1Q8IV20 430 aa13.04□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 TCEAL8Q8IYN2 117 aa13.04□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 OR7G2Q8NG99 324 aa13.04□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 OR2A12Q8NGT7 310 aa13.04□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 SEC22CQ9BRL7 303 aa13.04□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 HYKKA2RU49 373 aa13.04□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 C1orf196B1AJZ1 125 aa13.04□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 TXNL1O43396 289 aa13.04□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 CYBAP13498 195 aa13.04□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 TRIM23P36406 574 aa13.04□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 CAMLGP49069 296 aa13.04□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 VASPP50552 380 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 PFN3P60673 137 aa13.04□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 NSDHLQ15738 373 aa13.04□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 AWAT2Q6E213 333 aa13.04□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 LCTLQ6UWM7 567 aa13.04□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 MYEOVQ96EZ4 313 aa13.04□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 ADOQ96SZ5 270 aa13.04□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa13.04□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 APMAPQ9HDC9 416 aa13.04□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 MUTYHQ9UIF7 546 aa13.04□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa13.04□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 ANKRD61A6NGH8 418 aa13.03□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 TSPAN15O95858 294 aa13.03□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 CCL5P13501 91 aa13.03□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 KCNJ10P78508 379 aa13.03□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 NFATC4Q14934 902 aa13.03□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 PHF19Q5T6S3 580 aa13.03□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 GPR157Q5UAW9 335 aa13.03□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 SLC18B1Q6NT16 456 aa13.03□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 ACSM5Q6NUN0 579 aa13.03□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 TSSK4Q6SA08 328 aa13.03□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa13.03□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 GLCCI1Q86VQ1 547 aa13.03□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa13.03□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 OR14A2Q96R54 314 aa13.03□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 OR1F2PQ96R84 312 aa13.03□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 DDOQ99489 341 aa13.03□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa13.03□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 CDCP1Q9H5V8 836 aa13.03□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 RPS10P5Q9NQ39 176 aa13.03□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 ACER3Q9NUN7 267 aa13.03□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 CYP8B1Q9UNU6 501 aa13.03□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa13.03□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 PRAF2O60831 178 aa13.03□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 CAV2P51636 162 aa13.03□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 DYRK1AQ13627 763 aa13.03□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 GNMTQ14749 295 aa13.03□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 ESCO2Q56NI9 601 aa13.03□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 ZNF454Q8N9F8 522 aa13.03□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 ELP5Q8TE02 316 aa13.03□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 PHB2Q99623 299 aa13.03□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa13.03□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa13.03□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 PCM1Q15154 2024 aa13.03□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 AIFM1O95831 613 aa13.03□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 TMEM225BP0DP42 221 aa13.03□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 HOXC13P31276 330 aa13.03□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 HTR3AP46098 478 aa13.03□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 CTF1Q16619 201 aa13.03□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 DCST2Q5T1A1 773 aa13.03□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa13.03□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 LINC01599Q8WXQ3 324 aa13.03□□□□□ -0.32
RPS6KC1-208ENST00000614059 TMEM234Q8WY98 164 aa13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms