RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612121.4

LTBP4-233, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 4, human

TSL 3

Gene LTBP4, Length 755 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LTBP4-233	ENST00000612121	APH1A	Q96BI3	265 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	OR5B2	Q96R09	309 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	NAPG	Q99747	312 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	BTBD2	Q9BX70	525 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	EMC3	Q9P0I2	261 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	MALT1	Q9UDY8	824 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	UTP11	Q9Y3A2	253 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	NPIPA5	A0A0B4J1W7	369 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	CCDC151	A5D8V7	595 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	ZNF716	A6NP11	495 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	NPIPA7	E9PJI5	369 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	PDLIM1	O00151	329 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	NPIPA8	P0DM63	369 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	IMPDH1	P20839	514 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	DIO1	P49895	249 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	FOXA1	P55317	472 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	PKNOX1	P55347	436 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	GNG11	P61952	73 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	SNRPD2	P62316	118 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	SLC25A3	Q00325	362 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	LCP2	Q13094	533 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	QPRT	Q15274	297 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	ZNF385B	Q569K4	471 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	C3orf56	Q8N813	242 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	SPATA4	Q8NEY3	305 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	HPS1	Q92902	700 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	OCEL1	Q9H607	264 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	GIN1	Q9NXP7	522 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	METRN	Q9UJH8	293 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	STK38L	Q9Y2H1	464 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	NOSIP	Q9Y314	301 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	TMEM89	A2RUT3	159 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LTBP4-233	ENST00000612121	ESPN	B1AK53	854 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LTBP4-233	ENST00000612121	NPIPB8	E9PQR5	432 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LTBP4-233	ENST00000612121		H3BNH8	94 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LTBP4-233	ENST00000612121	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
LTBP4-233	ENST00000612121	LILRA1	O75019	489 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LTBP4-233	ENST00000612121	INHBA	P08476	426 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LTBP4-233	ENST00000612121	TACSTD2	P09758	323 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LTBP4-233	ENST00000612121	TAC1	P20366	129 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LTBP4-233	ENST00000612121	GIF	P27352	417 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LTBP4-233	ENST00000612121	PHB	P35232	272 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LTBP4-233	ENST00000612121	FRK	P42685	505 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
LTBP4-233	ENST00000612121	MLC1	Q15049	377 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LTBP4-233	ENST00000612121	C3orf33	Q6P1S2	294 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LTBP4-233	ENST00000612121	TMPPE	Q6ZT21	453 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LTBP4-233	ENST00000612121	TRIM46	Q7Z4K8	759 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LTBP4-233	ENST00000612121	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
LTBP4-233	ENST00000612121	ZNF527	Q8NB42	609 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LTBP4-233	ENST00000612121	OR5W2	Q8NH69	310 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LTBP4-233	ENST00000612121	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LTBP4-233	ENST00000612121	CDS1	Q92903	461 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LTBP4-233	ENST00000612121	ZNF764	Q96H86	408 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
LTBP4-233	ENST00000612121	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
LTBP4-233	ENST00000612121	FUT8	Q9BYC5	575 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LTBP4-233	ENST00000612121	HOXD1	Q9GZZ0	328 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LTBP4-233	ENST00000612121	IQCG	Q9H095	443 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
LTBP4-233	ENST00000612121	QRSL1	Q9H0R6	528 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
LTBP4-233	ENST00000612121	SLC17A5	Q9NRA2	495 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LTBP4-233	ENST00000612121	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LTBP4-233	ENST00000612121	MOK	Q9UQ07	419 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LTBP4-233	ENST00000612121	NPIPB9	F8W1W9	429 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LTBP4-233	ENST00000612121	SULT2B1	O00204	365 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LTBP4-233	ENST00000612121	SLU7	O95391	586 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
LTBP4-233	ENST00000612121	STAMBP	O95630	424 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LTBP4-233	ENST00000612121	SERPINF1	P36955	418 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LTBP4-233	ENST00000612121	SERPINB9	P50453	376 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LTBP4-233	ENST00000612121	CHN2	P52757	468 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LTBP4-233	ENST00000612121	CDH15	P55291	814 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LTBP4-233	ENST00000612121	ACTG1	P63261	375 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LTBP4-233	ENST00000612121	C2orf54	Q08AI8	447 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LTBP4-233	ENST00000612121	KIAA0040	Q15053	153 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LTBP4-233	ENST00000612121	IMPG1	Q17R60	797 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LTBP4-233	ENST00000612121	TIGD2	Q4W5G0	525 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LTBP4-233	ENST00000612121	DEF8	Q6ZN54	512 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LTBP4-233	ENST00000612121	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LTBP4-233	ENST00000612121	C17orf78	Q8N4C9	275 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LTBP4-233	ENST00000612121	OR52E4	Q8NGH9	312 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LTBP4-233	ENST00000612121	RFWD2	Q8NHY2	731 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LTBP4-233	ENST00000612121	JADE3	Q92613	823 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LTBP4-233	ENST00000612121	STAC	Q99469	402 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LTBP4-233	ENST00000612121	PAFAH2	Q99487	392 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LTBP4-233	ENST00000612121	RAB17	Q9H0T7	212 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LTBP4-233	ENST00000612121	NINJ2	Q9NZG7	142 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LTBP4-233	ENST00000612121	TMEM216	Q9P0N5	145 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LTBP4-233	ENST00000612121	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LTBP4-233	ENST00000612121	TRIM49D1	C9J1S8	452 aa		13.5	□□□□□ -0.25
LTBP4-233	ENST00000612121	TBX19	O60806	448 aa		13.5	□□□□□ -0.25
LTBP4-233	ENST00000612121	MRPL33	O75394	65 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
LTBP4-233	ENST00000612121	RSL1D1	O76021	490 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
LTBP4-233	ENST00000612121	ATP6V1C1	P21283	382 aa		13.5	□□□□□ -0.25
LTBP4-233	ENST00000612121	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
LTBP4-233	ENST00000612121	PRKAA2	P54646	552 aa		13.5	□□□□□ -0.25
LTBP4-233	ENST00000612121	ATP12A	P54707	1039 aa		13.5	□□□□□ -0.25
LTBP4-233	ENST00000612121	DVL1P1	P54792	670 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
LTBP4-233	ENST00000612121	CSNK2A1	P68400	391 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
LTBP4-233	ENST00000612121	C9orf135	Q5VTT2	229 aa		13.5	□□□□□ -0.25

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