RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586900.1

PKN1-208, Transcript of protein kinase N1, human

TSL 3

Gene PKN1, Length 550 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKN1-208	ENST00000586900	TMEM229A	B2RXF0	380 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	AP3D1	O14617	1153 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	FMO6P	O60774	539 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	GMNN	O75496	209 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	WISP1	O95388	367 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	TPO	P07202	933 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	GKN3P	P0CG01	181 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	GABRA1	P14867	456 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	ZNF708	P17019	499 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	MAP2K6	P52564	334 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	ZNF136	P52737	540 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	CASP6	P55212	293 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	CLDN18	P56856	261 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	RGS8	P57771	180 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	SELENOW	P63302	87 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	FOXF1	Q12946	379 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	BNIP2	Q12982	314 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	CEACAM7	Q14002	265 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	EIF2S3L	Q2VIR3	472 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	DNAL1	Q4LDG9	190 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	LRRC23	Q53EV4	343 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	CYBRD1	Q53TN4	286 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	GLYAT	Q6IB77	296 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	WBP2NL	Q6ICG8	309 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	PLEKHM3	Q6ZWE6	761 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	CD163	Q86VB7	1156 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	COMTD1	Q86VU5	262 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	DOLPP1	Q86YN1	238 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	RNF148	Q8N7C7	305 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	LSMEM1	Q8N8F7	131 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	OR52E4	Q8NGH9	312 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	LZIC	Q8WZA0	190 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	RELT	Q969Z4	430 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	NPAS1	Q99742	590 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	ARHGDIG	Q99819	225 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	TRIM2	Q9C040	744 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	TP63	Q9H3D4	680 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	ADPRHL2	Q9NX46	363 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	TES	Q9UGI8	421 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900		A0A1B0GUH1	482 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	FIGNL2	A6NMB9	653 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	SHISA8	B8ZZ34	492 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	GYG2	O15488	501 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	ZNHIT1	O43257	154 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	EFNA2	O43921	213 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	PRG2	P13727	222 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	POU3F2	P20265	443 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	TCEA1	P23193	301 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	ME2	P23368	584 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	UQCRFS1	P47985	274 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	STAR	P49675	285 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	CLK1	P49759	484 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	MERTK	Q12866	999 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	SELENBP1	Q13228	472 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	C3AR1	Q16581	482 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	DCST1	Q5T197	706 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	CBLL1	Q75N03	491 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	RANBP3L	Q86VV4	465 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	ULK2	Q8IYT8	1036 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	MEIOB	Q8N635	442 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	OR5M1	Q8NGP8	315 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	ZPLD1	Q8TCW7	415 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	PROX1	Q92786	737 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	FAM162A	Q96A26	154 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	UCN2	Q96RP3	112 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	ZNF559	Q9BR84	538 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	MUC13	Q9H3R2	512 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	C12orf10	Q9HB07	376 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	SERINC1	Q9NRX5	453 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	PNPLA3	Q9NST1	481 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	TNFRSF10D	Q9UBN6	386 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	EGFL7	Q9UHF1	273 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	RPS6KA6	Q9UK32	745 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	SLC9A8	Q9Y2E8	581 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	SPIN1	Q9Y657	262 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	TRGV8	A0A0C4DH27	118 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	GJE1	A6NN92	205 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900		E9PLN8	166 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900		H3BML4	177 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	EBAG9	O00559	213 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	ADAMDEC1	O15204	470 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	FRS3	O43559	492 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	TCN1	P20061	433 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	ACVR2A	P27037	513 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	POLR2H	P52434	150 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	NCALD	P61601	193 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	C4orf17	Q53FE4	359 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	C3orf33	Q6P1S2	294 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	ESPNL	Q6ZVH7	1005 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	ADGRE4P	Q86SQ3	457 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	GGN	Q86UU5	652 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	ADGRG3	Q86Y34	549 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	LILRA2	Q8N149	483 aa		11.11	□□□□□ -0.63

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