RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 STX1BP61266 288 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 SORDQ00796 357 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 FAM27E3Q08E93 113 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 FOXF1Q12946 379 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 FGFBP1Q14512 234 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 QPRTQ15274 297 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF141Q15928 474 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 FAM214BQ7L5A3 538 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 SPATA21Q7Z572 469 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 BTLAQ7Z6A9 289 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 HMGN2P46Q86SG4 172 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF619Q8N2I2 560 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 MIER2Q8N344 545 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF610Q8N9Z0 462 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF563Q8TA94 476 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 POC1BQ8TC44 478 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 MIPOL1Q8TD10 442 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 GPR119Q8TDV5 335 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM234Q8WY98 164 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 ROBO4Q8WZ75 1007 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 NEURL3Q96EH8 262 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 MAGEB18Q96M61 343 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 CCDC115Q96NT0 180 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 DACH2Q96NX9 599 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 OR52B2Q96RD2 323 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 KLHDC3Q9BQ90 382 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 NMUR2Q9GZQ4 415 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF350Q9GZX5 532 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 LAT2Q9GZY6 243 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 RMND5AQ9H871 391 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 SERINC1Q9NRX5 453 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 RASSF1Q9NS23 344 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 JKAMPQ9P055 326 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 ICAM5Q9UMF0 924 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 EDARQ9UNE0 448 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 EMC9Q9Y3B6 208 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 USH1CQ9Y6N9 552 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 F8P00451 2351 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 SH3D21A4FU49 640 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 NPIPB9F8W1W9 429 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 ADAMDEC1O15204 470 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 H6PDO95479 791 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 NR2F1P10589 423 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 PRKCAP17252 672 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 PGCP20142 388 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 IL11P20809 199 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 CALB2P22676 271 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 ELK4P28324 431 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 SLC7A1P30825 629 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 RYKP34925 604 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 CD79BP40259 229 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 CDKN2CP42773 168 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 CRATP43155 626 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 SLC6A8P48029 635 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 CHRNEQ04844 493 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 GNA13Q14344 377 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 POU4F3Q15319 338 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 C6orf10Q5SRN2 563 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 EPGNQ6UW88 154 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 MAVSQ7Z434 540 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 EGFL6Q8IUX8 553 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 NRGNQ92686 78 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 ITCHQ96J02 903 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 MRGPRX4Q96LA9 322 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 KLHL4Q9C0H6 718 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 LRMDAQ9H2I8 198 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 FANCFQ9NPI8 374 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 POLE3Q9NRF9 147 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 GLRX2Q9NS18 164 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 ELOVL5Q9NYP7 299 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 ZIM2Q9NZV7 527 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 KLHL14Q9P2G3 628 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 KCNE5Q9UJ90 142 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 LIPT1Q9Y234 373 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 SPG11Q96JI7 2443 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 A0A1W2PNR3 127 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM247A6NEH6 219 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 C16orf97H3BN30 126 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 HMGN4O00479 90 aa7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms