RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 SYPL1Q16563 259 aa20■□□□□ 0.79
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PTPRM-211ENST00000580170 SLC2A12Q8TD20 617 aa20■□□□□ 0.79
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PTPRM-211ENST00000580170 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa19.98■□□□□ 0.79
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PTPRM-211ENST00000580170 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
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PTPRM-211ENST00000580170 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
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